Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msl2Q69ZF8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msl2Q69ZF8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msl2Q69ZF8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msl2Q69ZF8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msl2Q69ZF8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msl2Q69ZF8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msl2Q69ZF8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msl2Q69ZF8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msl2Q69ZF8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msl2Q69ZF8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msl2Q69ZF8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msl2Q69ZF8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Msl2Q69ZF8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msl2Q69ZF8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msl2Q69ZF8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Msl2Q69ZF8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Msl2Q69ZF8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msl2Q69ZF8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msl2Q69ZF8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msl2Q69ZF8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msl2Q69ZF8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msl2Q69ZF8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msl2Q69ZF8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msl2Q69ZF8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msl2Q69ZF8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msl2Q69ZF8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Msl2Q69ZF8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msl2Q69ZF8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msl2Q69ZF8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msl2Q69ZF8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msl2Q69ZF8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msl2Q69ZF8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msl2Q69ZF8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msl2Q69ZF8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msl2Q69ZF8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msl2Q69ZF8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msl2Q69ZF8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msl2Q69ZF8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msl2Q69ZF8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msl2Q69ZF8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msl2Q69ZF8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msl2Q69ZF8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msl2Q69ZF8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msl2Q69ZF8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msl2Q69ZF8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msl2Q69ZF8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msl2Q69ZF8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msl2Q69ZF8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msl2Q69ZF8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msl2Q69ZF8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msl2Q69ZF8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Msl2Q69ZF8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Msl2Q69ZF8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Msl2Q69ZF8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Msl2Q69ZF8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Msl2Q69ZF8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Msl2Q69ZF8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Msl2Q69ZF8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Msl2Q69ZF8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Msl2Q69ZF8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Msl2Q69ZF8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Msl2Q69ZF8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Msl2Q69ZF8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Msl2Q69ZF8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Msl2Q69ZF8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Msl2Q69ZF8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Msl2Q69ZF8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msl2Q69ZF8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msl2Q69ZF8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msl2Q69ZF8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Msl2Q69ZF8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msl2Q69ZF8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msl2Q69ZF8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msl2Q69ZF8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msl2Q69ZF8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msl2Q69ZF8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msl2Q69ZF8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msl2Q69ZF8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msl2Q69ZF8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msl2Q69ZF8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msl2Q69ZF8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msl2Q69ZF8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Msl2Q69ZF8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msl2Q69ZF8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msl2Q69ZF8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Msl2Q69ZF8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Msl2Q69ZF8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msl2Q69ZF8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Msl2Q69ZF8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msl2Q69ZF8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msl2Q69ZF8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msl2Q69ZF8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msl2Q69ZF8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msl2Q69ZF8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msl2Q69ZF8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msl2Q69ZF8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msl2Q69ZF8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msl2Q69ZF8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msl2Q69ZF8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms