Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB0

Lrrcc1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrcc1Q69ZB0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrcc1Q69ZB0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrcc1Q69ZB0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrcc1Q69ZB0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrcc1Q69ZB0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrcc1Q69ZB0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrcc1Q69ZB0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrcc1Q69ZB0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrcc1Q69ZB0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrcc1Q69ZB0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrcc1Q69ZB0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrcc1Q69ZB0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrcc1Q69ZB0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrcc1Q69ZB0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrcc1Q69ZB0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrcc1Q69ZB0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrcc1Q69ZB0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrcc1Q69ZB0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrcc1Q69ZB0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrcc1Q69ZB0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrcc1Q69ZB0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrcc1Q69ZB0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrcc1Q69ZB0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrcc1Q69ZB0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrcc1Q69ZB0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrcc1Q69ZB0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrcc1Q69ZB0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrcc1Q69ZB0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrcc1Q69ZB0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrrcc1Q69ZB0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrrcc1Q69ZB0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrrcc1Q69ZB0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrrcc1Q69ZB0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lrrcc1Q69ZB0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lrrcc1Q69ZB0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrcc1Q69ZB0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrcc1Q69ZB0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrcc1Q69ZB0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrcc1Q69ZB0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrcc1Q69ZB0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrcc1Q69ZB0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrcc1Q69ZB0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrcc1Q69ZB0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrcc1Q69ZB0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrcc1Q69ZB0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrcc1Q69ZB0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrcc1Q69ZB0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrcc1Q69ZB0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrcc1Q69ZB0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrcc1Q69ZB0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrcc1Q69ZB0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrcc1Q69ZB0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrcc1Q69ZB0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrcc1Q69ZB0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrcc1Q69ZB0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrcc1Q69ZB0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrcc1Q69ZB0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrcc1Q69ZB0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrcc1Q69ZB0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrcc1Q69ZB0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrcc1Q69ZB0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrcc1Q69ZB0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrcc1Q69ZB0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrcc1Q69ZB0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrcc1Q69ZB0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrcc1Q69ZB0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrcc1Q69ZB0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrcc1Q69ZB0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrcc1Q69ZB0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrcc1Q69ZB0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrcc1Q69ZB0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrcc1Q69ZB0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrcc1Q69ZB0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrcc1Q69ZB0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrcc1Q69ZB0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrcc1Q69ZB0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrcc1Q69ZB0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrcc1Q69ZB0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrcc1Q69ZB0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrcc1Q69ZB0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrcc1Q69ZB0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrcc1Q69ZB0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrcc1Q69ZB0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrcc1Q69ZB0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrcc1Q69ZB0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrcc1Q69ZB0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrcc1Q69ZB0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrcc1Q69ZB0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrcc1Q69ZB0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrcc1Q69ZB0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrcc1Q69ZB0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrcc1Q69ZB0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrcc1Q69ZB0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrcc1Q69ZB0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrcc1Q69ZB0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrcc1Q69ZB0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrcc1Q69ZB0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrcc1Q69ZB0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrcc1Q69ZB0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrcc1Q69ZB0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms