Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZA1

Cdk13, Cyclin-dependent kinase 13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk13Q69ZA1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cdk13Q69ZA1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cdk13Q69ZA1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cdk13Q69ZA1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cdk13Q69ZA1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cdk13Q69ZA1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cdk13Q69ZA1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cdk13Q69ZA1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cdk13Q69ZA1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cdk13Q69ZA1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cdk13Q69ZA1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cdk13Q69ZA1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cdk13Q69ZA1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cdk13Q69ZA1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cdk13Q69ZA1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Cdk13Q69ZA1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Cdk13Q69ZA1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Cdk13Q69ZA1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cdk13Q69ZA1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cdk13Q69ZA1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cdk13Q69ZA1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cdk13Q69ZA1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cdk13Q69ZA1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Cdk13Q69ZA1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cdk13Q69ZA1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cdk13Q69ZA1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cdk13Q69ZA1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cdk13Q69ZA1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cdk13Q69ZA1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cdk13Q69ZA1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cdk13Q69ZA1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cdk13Q69ZA1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cdk13Q69ZA1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cdk13Q69ZA1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cdk13Q69ZA1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cdk13Q69ZA1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cdk13Q69ZA1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cdk13Q69ZA1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cdk13Q69ZA1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cdk13Q69ZA1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cdk13Q69ZA1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cdk13Q69ZA1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cdk13Q69ZA1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cdk13Q69ZA1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cdk13Q69ZA1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cdk13Q69ZA1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cdk13Q69ZA1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Cdk13Q69ZA1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cdk13Q69ZA1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cdk13Q69ZA1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cdk13Q69ZA1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cdk13Q69ZA1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cdk13Q69ZA1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cdk13Q69ZA1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cdk13Q69ZA1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cdk13Q69ZA1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cdk13Q69ZA1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Cdk13Q69ZA1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Cdk13Q69ZA1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Cdk13Q69ZA1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Cdk13Q69ZA1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cdk13Q69ZA1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cdk13Q69ZA1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cdk13Q69ZA1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cdk13Q69ZA1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cdk13Q69ZA1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Cdk13Q69ZA1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cdk13Q69ZA1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cdk13Q69ZA1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cdk13Q69ZA1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cdk13Q69ZA1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cdk13Q69ZA1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cdk13Q69ZA1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cdk13Q69ZA1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cdk13Q69ZA1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Cdk13Q69ZA1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Cdk13Q69ZA1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cdk13Q69ZA1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cdk13Q69ZA1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cdk13Q69ZA1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cdk13Q69ZA1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cdk13Q69ZA1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cdk13Q69ZA1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cdk13Q69ZA1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cdk13Q69ZA1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cdk13Q69ZA1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cdk13Q69ZA1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cdk13Q69ZA1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Cdk13Q69ZA1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cdk13Q69ZA1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cdk13Q69ZA1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cdk13Q69ZA1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cdk13Q69ZA1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cdk13Q69ZA1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cdk13Q69ZA1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cdk13Q69ZA1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cdk13Q69ZA1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cdk13Q69ZA1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Cdk13Q69ZA1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cdk13Q69ZA1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms