Protein–RNA interactions for Protein: Q68ED3

Papd5, Non-canonical poly(A) RNA polymerase PAPD5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Papd5Q68ED3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Papd5Q68ED3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Papd5Q68ED3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Papd5Q68ED3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Papd5Q68ED3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Papd5Q68ED3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Papd5Q68ED3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Papd5Q68ED3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Papd5Q68ED3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Papd5Q68ED3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Papd5Q68ED3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Papd5Q68ED3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Papd5Q68ED3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Papd5Q68ED3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Papd5Q68ED3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Papd5Q68ED3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Papd5Q68ED3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Papd5Q68ED3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Papd5Q68ED3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Papd5Q68ED3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Papd5Q68ED3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Papd5Q68ED3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Papd5Q68ED3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Papd5Q68ED3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Papd5Q68ED3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Papd5Q68ED3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Papd5Q68ED3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Papd5Q68ED3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Papd5Q68ED3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Papd5Q68ED3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Papd5Q68ED3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Papd5Q68ED3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Papd5Q68ED3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Papd5Q68ED3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Papd5Q68ED3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Papd5Q68ED3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Papd5Q68ED3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Papd5Q68ED3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Papd5Q68ED3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Papd5Q68ED3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Papd5Q68ED3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Papd5Q68ED3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Papd5Q68ED3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Papd5Q68ED3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Papd5Q68ED3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Papd5Q68ED3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Papd5Q68ED3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Papd5Q68ED3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Papd5Q68ED3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Papd5Q68ED3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Papd5Q68ED3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Papd5Q68ED3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Papd5Q68ED3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Papd5Q68ED3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Papd5Q68ED3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Papd5Q68ED3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Papd5Q68ED3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Papd5Q68ED3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Papd5Q68ED3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Papd5Q68ED3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Papd5Q68ED3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Papd5Q68ED3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Papd5Q68ED3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Papd5Q68ED3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Papd5Q68ED3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Papd5Q68ED3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Papd5Q68ED3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Papd5Q68ED3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Papd5Q68ED3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Papd5Q68ED3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Papd5Q68ED3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Papd5Q68ED3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Papd5Q68ED3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Papd5Q68ED3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Papd5Q68ED3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Papd5Q68ED3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Papd5Q68ED3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Papd5Q68ED3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Papd5Q68ED3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Papd5Q68ED3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Papd5Q68ED3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Papd5Q68ED3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Papd5Q68ED3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Papd5Q68ED3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Papd5Q68ED3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Papd5Q68ED3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Papd5Q68ED3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Papd5Q68ED3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Papd5Q68ED3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Papd5Q68ED3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Papd5Q68ED3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Papd5Q68ED3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Papd5Q68ED3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Papd5Q68ED3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Papd5Q68ED3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Papd5Q68ED3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Papd5Q68ED3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Papd5Q68ED3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Papd5Q68ED3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Papd5Q68ED3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms