Protein–RNA interactions for Protein: Q66K08

Cilp, Cartilage intermediate layer protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CilpQ66K08 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CilpQ66K08 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CilpQ66K08 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CilpQ66K08 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CilpQ66K08 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CilpQ66K08 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CilpQ66K08 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CilpQ66K08 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CilpQ66K08 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CilpQ66K08 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CilpQ66K08 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CilpQ66K08 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CilpQ66K08 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CilpQ66K08 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CilpQ66K08 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CilpQ66K08 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CilpQ66K08 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CilpQ66K08 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CilpQ66K08 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CilpQ66K08 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CilpQ66K08 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CilpQ66K08 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CilpQ66K08 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CilpQ66K08 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CilpQ66K08 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CilpQ66K08 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CilpQ66K08 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CilpQ66K08 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CilpQ66K08 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CilpQ66K08 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CilpQ66K08 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CilpQ66K08 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CilpQ66K08 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CilpQ66K08 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CilpQ66K08 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CilpQ66K08 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CilpQ66K08 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CilpQ66K08 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CilpQ66K08 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CilpQ66K08 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CilpQ66K08 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CilpQ66K08 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CilpQ66K08 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CilpQ66K08 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CilpQ66K08 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CilpQ66K08 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CilpQ66K08 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CilpQ66K08 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CilpQ66K08 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CilpQ66K08 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CilpQ66K08 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CilpQ66K08 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CilpQ66K08 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CilpQ66K08 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CilpQ66K08 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CilpQ66K08 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CilpQ66K08 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CilpQ66K08 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CilpQ66K08 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CilpQ66K08 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CilpQ66K08 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CilpQ66K08 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CilpQ66K08 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CilpQ66K08 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CilpQ66K08 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CilpQ66K08 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CilpQ66K08 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CilpQ66K08 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CilpQ66K08 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CilpQ66K08 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CilpQ66K08 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CilpQ66K08 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CilpQ66K08 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CilpQ66K08 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CilpQ66K08 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CilpQ66K08 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CilpQ66K08 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CilpQ66K08 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CilpQ66K08 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CilpQ66K08 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CilpQ66K08 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CilpQ66K08 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CilpQ66K08 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CilpQ66K08 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CilpQ66K08 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CilpQ66K08 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CilpQ66K08 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CilpQ66K08 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CilpQ66K08 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CilpQ66K08 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CilpQ66K08 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CilpQ66K08 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CilpQ66K08 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CilpQ66K08 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CilpQ66K08 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CilpQ66K08 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CilpQ66K08 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CilpQ66K08 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CilpQ66K08 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
CilpQ66K08 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms