Protein–RNA interactions for Protein: Q64455

Ptprj, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, mousemouse

Predictions only

Length 1,238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprjQ64455 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtprjQ64455 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtprjQ64455 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PtprjQ64455 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PtprjQ64455 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprjQ64455 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprjQ64455 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprjQ64455 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprjQ64455 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprjQ64455 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprjQ64455 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprjQ64455 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprjQ64455 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprjQ64455 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprjQ64455 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprjQ64455 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprjQ64455 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprjQ64455 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprjQ64455 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprjQ64455 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprjQ64455 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtprjQ64455 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtprjQ64455 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtprjQ64455 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtprjQ64455 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtprjQ64455 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtprjQ64455 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtprjQ64455 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtprjQ64455 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtprjQ64455 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtprjQ64455 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtprjQ64455 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PtprjQ64455 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtprjQ64455 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtprjQ64455 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtprjQ64455 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtprjQ64455 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtprjQ64455 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtprjQ64455 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtprjQ64455 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PtprjQ64455 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtprjQ64455 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtprjQ64455 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtprjQ64455 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtprjQ64455 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprjQ64455 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprjQ64455 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprjQ64455 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprjQ64455 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprjQ64455 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprjQ64455 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprjQ64455 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprjQ64455 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprjQ64455 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprjQ64455 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprjQ64455 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PtprjQ64455 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PtprjQ64455 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PtprjQ64455 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PtprjQ64455 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PtprjQ64455 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PtprjQ64455 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprjQ64455 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprjQ64455 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprjQ64455 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprjQ64455 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprjQ64455 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprjQ64455 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprjQ64455 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprjQ64455 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprjQ64455 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprjQ64455 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprjQ64455 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprjQ64455 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprjQ64455 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtprjQ64455 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtprjQ64455 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtprjQ64455 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtprjQ64455 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtprjQ64455 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtprjQ64455 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtprjQ64455 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtprjQ64455 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtprjQ64455 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtprjQ64455 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtprjQ64455 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtprjQ64455 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PtprjQ64455 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PtprjQ64455 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PtprjQ64455 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtprjQ64455 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PtprjQ64455 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtprjQ64455 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtprjQ64455 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtprjQ64455 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtprjQ64455 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PtprjQ64455 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PtprjQ64455 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PtprjQ64455 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PtprjQ64455 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms