Protein–RNA interactions for Protein: Q64444

Ca4, Carbonic anhydrase 4, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ca4Q64444 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ca4Q64444 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ca4Q64444 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ca4Q64444 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ca4Q64444 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ca4Q64444 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Ca4Q64444 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ca4Q64444 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ca4Q64444 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ca4Q64444 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ca4Q64444 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ca4Q64444 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ca4Q64444 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ca4Q64444 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ca4Q64444 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ca4Q64444 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ca4Q64444 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Ca4Q64444 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ca4Q64444 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ca4Q64444 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ca4Q64444 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ca4Q64444 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ca4Q64444 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Ca4Q64444 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ca4Q64444 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ca4Q64444 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ca4Q64444 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ca4Q64444 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ca4Q64444 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ca4Q64444 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ca4Q64444 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ca4Q64444 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ca4Q64444 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ca4Q64444 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ca4Q64444 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ca4Q64444 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ca4Q64444 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ca4Q64444 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ca4Q64444 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ca4Q64444 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ca4Q64444 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ca4Q64444 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ca4Q64444 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ca4Q64444 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ca4Q64444 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ca4Q64444 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ca4Q64444 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ca4Q64444 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ca4Q64444 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ca4Q64444 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ca4Q64444 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ca4Q64444 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ca4Q64444 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ca4Q64444 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ca4Q64444 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ca4Q64444 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ca4Q64444 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ca4Q64444 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ca4Q64444 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ca4Q64444 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ca4Q64444 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ca4Q64444 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ca4Q64444 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ca4Q64444 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ca4Q64444 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ca4Q64444 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ca4Q64444 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ca4Q64444 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ca4Q64444 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ca4Q64444 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ca4Q64444 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ca4Q64444 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ca4Q64444 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ca4Q64444 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ca4Q64444 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ca4Q64444 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ca4Q64444 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ca4Q64444 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ca4Q64444 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ca4Q64444 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ca4Q64444 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ca4Q64444 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ca4Q64444 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ca4Q64444 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ca4Q64444 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ca4Q64444 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ca4Q64444 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ca4Q64444 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ca4Q64444 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ca4Q64444 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ca4Q64444 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ca4Q64444 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Ca4Q64444 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ca4Q64444 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ca4Q64444 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ca4Q64444 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ca4Q64444 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ca4Q64444 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ca4Q64444 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ca4Q64444 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms