Protein–RNA interactions for Protein: Q64282

Ifit1, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit1Q64282 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ifit1Q64282 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ifit1Q64282 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ifit1Q64282 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ifit1Q64282 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ifit1Q64282 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ifit1Q64282 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ifit1Q64282 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ifit1Q64282 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ifit1Q64282 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ifit1Q64282 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ifit1Q64282 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ifit1Q64282 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ifit1Q64282 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ifit1Q64282 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ifit1Q64282 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ifit1Q64282 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ifit1Q64282 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ifit1Q64282 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ifit1Q64282 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ifit1Q64282 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ifit1Q64282 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ifit1Q64282 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ifit1Q64282 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ifit1Q64282 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ifit1Q64282 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ifit1Q64282 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ifit1Q64282 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ifit1Q64282 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ifit1Q64282 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ifit1Q64282 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ifit1Q64282 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ifit1Q64282 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ifit1Q64282 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ifit1Q64282 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ifit1Q64282 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ifit1Q64282 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ifit1Q64282 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ifit1Q64282 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ifit1Q64282 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ifit1Q64282 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ifit1Q64282 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ifit1Q64282 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ifit1Q64282 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ifit1Q64282 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ifit1Q64282 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ifit1Q64282 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ifit1Q64282 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ifit1Q64282 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ifit1Q64282 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ifit1Q64282 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ifit1Q64282 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ifit1Q64282 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ifit1Q64282 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ifit1Q64282 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ifit1Q64282 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ifit1Q64282 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ifit1Q64282 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ifit1Q64282 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ifit1Q64282 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ifit1Q64282 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ifit1Q64282 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ifit1Q64282 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ifit1Q64282 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ifit1Q64282 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ifit1Q64282 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ifit1Q64282 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ifit1Q64282 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ifit1Q64282 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ifit1Q64282 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ifit1Q64282 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ifit1Q64282 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ifit1Q64282 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ifit1Q64282 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ifit1Q64282 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ifit1Q64282 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ifit1Q64282 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ifit1Q64282 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ifit1Q64282 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ifit1Q64282 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ifit1Q64282 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ifit1Q64282 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ifit1Q64282 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ifit1Q64282 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ifit1Q64282 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ifit1Q64282 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ifit1Q64282 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ifit1Q64282 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ifit1Q64282 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ifit1Q64282 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ifit1Q64282 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ifit1Q64282 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ifit1Q64282 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ifit1Q64282 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ifit1Q64282 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ifit1Q64282 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ifit1Q64282 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ifit1Q64282 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ifit1Q64282 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ifit1Q64282 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms