Protein–RNA interactions for Protein: Q64221

Nhlh2, Helix-loop-helix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh2Q64221 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nhlh2Q64221 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nhlh2Q64221 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nhlh2Q64221 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nhlh2Q64221 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nhlh2Q64221 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nhlh2Q64221 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nhlh2Q64221 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nhlh2Q64221 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nhlh2Q64221 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nhlh2Q64221 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nhlh2Q64221 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nhlh2Q64221 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nhlh2Q64221 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nhlh2Q64221 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nhlh2Q64221 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nhlh2Q64221 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nhlh2Q64221 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nhlh2Q64221 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nhlh2Q64221 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nhlh2Q64221 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nhlh2Q64221 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nhlh2Q64221 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nhlh2Q64221 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nhlh2Q64221 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nhlh2Q64221 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nhlh2Q64221 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nhlh2Q64221 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nhlh2Q64221 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nhlh2Q64221 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nhlh2Q64221 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nhlh2Q64221 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nhlh2Q64221 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nhlh2Q64221 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nhlh2Q64221 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nhlh2Q64221 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nhlh2Q64221 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nhlh2Q64221 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nhlh2Q64221 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nhlh2Q64221 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nhlh2Q64221 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nhlh2Q64221 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nhlh2Q64221 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nhlh2Q64221 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nhlh2Q64221 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nhlh2Q64221 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nhlh2Q64221 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nhlh2Q64221 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nhlh2Q64221 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nhlh2Q64221 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nhlh2Q64221 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nhlh2Q64221 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nhlh2Q64221 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nhlh2Q64221 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nhlh2Q64221 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nhlh2Q64221 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nhlh2Q64221 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nhlh2Q64221 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nhlh2Q64221 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nhlh2Q64221 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nhlh2Q64221 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nhlh2Q64221 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nhlh2Q64221 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nhlh2Q64221 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nhlh2Q64221 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nhlh2Q64221 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nhlh2Q64221 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nhlh2Q64221 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nhlh2Q64221 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nhlh2Q64221 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nhlh2Q64221 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nhlh2Q64221 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nhlh2Q64221 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nhlh2Q64221 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nhlh2Q64221 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nhlh2Q64221 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nhlh2Q64221 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nhlh2Q64221 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nhlh2Q64221 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nhlh2Q64221 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nhlh2Q64221 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nhlh2Q64221 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nhlh2Q64221 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nhlh2Q64221 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nhlh2Q64221 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nhlh2Q64221 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nhlh2Q64221 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nhlh2Q64221 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nhlh2Q64221 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nhlh2Q64221 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nhlh2Q64221 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nhlh2Q64221 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nhlh2Q64221 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nhlh2Q64221 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nhlh2Q64221 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nhlh2Q64221 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nhlh2Q64221 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nhlh2Q64221 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nhlh2Q64221 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nhlh2Q64221 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms