Protein–RNA interactions for Protein: Q64092

Tfe3, Transcription factor E3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfe3Q64092 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tfe3Q64092 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tfe3Q64092 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tfe3Q64092 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tfe3Q64092 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tfe3Q64092 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tfe3Q64092 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tfe3Q64092 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tfe3Q64092 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tfe3Q64092 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tfe3Q64092 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tfe3Q64092 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tfe3Q64092 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tfe3Q64092 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tfe3Q64092 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tfe3Q64092 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tfe3Q64092 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tfe3Q64092 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tfe3Q64092 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tfe3Q64092 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tfe3Q64092 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tfe3Q64092 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tfe3Q64092 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tfe3Q64092 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tfe3Q64092 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tfe3Q64092 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tfe3Q64092 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tfe3Q64092 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tfe3Q64092 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tfe3Q64092 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tfe3Q64092 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tfe3Q64092 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tfe3Q64092 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tfe3Q64092 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tfe3Q64092 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tfe3Q64092 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tfe3Q64092 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tfe3Q64092 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tfe3Q64092 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tfe3Q64092 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tfe3Q64092 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tfe3Q64092 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tfe3Q64092 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tfe3Q64092 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tfe3Q64092 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tfe3Q64092 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tfe3Q64092 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tfe3Q64092 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tfe3Q64092 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tfe3Q64092 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tfe3Q64092 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tfe3Q64092 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tfe3Q64092 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tfe3Q64092 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tfe3Q64092 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tfe3Q64092 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tfe3Q64092 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tfe3Q64092 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tfe3Q64092 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tfe3Q64092 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tfe3Q64092 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tfe3Q64092 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tfe3Q64092 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tfe3Q64092 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tfe3Q64092 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tfe3Q64092 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tfe3Q64092 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Tfe3Q64092 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tfe3Q64092 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tfe3Q64092 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tfe3Q64092 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tfe3Q64092 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tfe3Q64092 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tfe3Q64092 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tfe3Q64092 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tfe3Q64092 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tfe3Q64092 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tfe3Q64092 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tfe3Q64092 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tfe3Q64092 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tfe3Q64092 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tfe3Q64092 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tfe3Q64092 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tfe3Q64092 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tfe3Q64092 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tfe3Q64092 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tfe3Q64092 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tfe3Q64092 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tfe3Q64092 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tfe3Q64092 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Tfe3Q64092 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tfe3Q64092 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tfe3Q64092 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tfe3Q64092 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tfe3Q64092 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tfe3Q64092 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tfe3Q64092 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tfe3Q64092 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tfe3Q64092 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tfe3Q64092 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms