Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col4a5Q63ZW6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col4a5Q63ZW6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Col4a5Q63ZW6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col4a5Q63ZW6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Col4a5Q63ZW6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Col4a5Q63ZW6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Col4a5Q63ZW6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Col4a5Q63ZW6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Col4a5Q63ZW6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Col4a5Q63ZW6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Col4a5Q63ZW6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Col4a5Q63ZW6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Col4a5Q63ZW6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Col4a5Q63ZW6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Col4a5Q63ZW6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Col4a5Q63ZW6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Col4a5Q63ZW6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Col4a5Q63ZW6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Col4a5Q63ZW6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Col4a5Q63ZW6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Col4a5Q63ZW6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Col4a5Q63ZW6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Col4a5Q63ZW6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Col4a5Q63ZW6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Col4a5Q63ZW6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Col4a5Q63ZW6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Col4a5Q63ZW6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Col4a5Q63ZW6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Col4a5Q63ZW6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Col4a5Q63ZW6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Col4a5Q63ZW6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Col4a5Q63ZW6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Col4a5Q63ZW6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Col4a5Q63ZW6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Col4a5Q63ZW6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Col4a5Q63ZW6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Col4a5Q63ZW6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Col4a5Q63ZW6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Col4a5Q63ZW6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col4a5Q63ZW6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col4a5Q63ZW6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col4a5Q63ZW6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col4a5Q63ZW6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col4a5Q63ZW6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col4a5Q63ZW6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col4a5Q63ZW6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col4a5Q63ZW6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col4a5Q63ZW6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col4a5Q63ZW6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col4a5Q63ZW6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Col4a5Q63ZW6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Col4a5Q63ZW6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Col4a5Q63ZW6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Col4a5Q63ZW6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Col4a5Q63ZW6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Col4a5Q63ZW6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Col4a5Q63ZW6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Col4a5Q63ZW6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Col4a5Q63ZW6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Col4a5Q63ZW6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Col4a5Q63ZW6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Col4a5Q63ZW6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Col4a5Q63ZW6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Col4a5Q63ZW6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Col4a5Q63ZW6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Col4a5Q63ZW6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Col4a5Q63ZW6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Col4a5Q63ZW6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Col4a5Q63ZW6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Col4a5Q63ZW6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Col4a5Q63ZW6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col4a5Q63ZW6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col4a5Q63ZW6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col4a5Q63ZW6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col4a5Q63ZW6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col4a5Q63ZW6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col4a5Q63ZW6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Col4a5Q63ZW6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col4a5Q63ZW6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col4a5Q63ZW6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col4a5Q63ZW6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col4a5Q63ZW6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Col4a5Q63ZW6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Col4a5Q63ZW6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Col4a5Q63ZW6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col4a5Q63ZW6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col4a5Q63ZW6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col4a5Q63ZW6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Col4a5Q63ZW6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col4a5Q63ZW6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Col4a5Q63ZW6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Col4a5Q63ZW6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col4a5Q63ZW6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col4a5Q63ZW6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col4a5Q63ZW6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col4a5Q63ZW6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col4a5Q63ZW6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Col4a5Q63ZW6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Col4a5Q63ZW6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms