Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sp4Q62445 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sp4Q62445 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sp4Q62445 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sp4Q62445 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sp4Q62445 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sp4Q62445 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Sp4Q62445 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sp4Q62445 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Sp4Q62445 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sp4Q62445 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sp4Q62445 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sp4Q62445 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sp4Q62445 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sp4Q62445 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sp4Q62445 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sp4Q62445 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sp4Q62445 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sp4Q62445 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sp4Q62445 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sp4Q62445 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sp4Q62445 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sp4Q62445 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sp4Q62445 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sp4Q62445 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sp4Q62445 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sp4Q62445 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sp4Q62445 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sp4Q62445 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sp4Q62445 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sp4Q62445 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sp4Q62445 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sp4Q62445 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Sp4Q62445 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sp4Q62445 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Sp4Q62445 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sp4Q62445 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sp4Q62445 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sp4Q62445 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sp4Q62445 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sp4Q62445 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sp4Q62445 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sp4Q62445 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sp4Q62445 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sp4Q62445 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sp4Q62445 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sp4Q62445 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sp4Q62445 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Sp4Q62445 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Sp4Q62445 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Sp4Q62445 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sp4Q62445 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sp4Q62445 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sp4Q62445 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sp4Q62445 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sp4Q62445 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sp4Q62445 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Sp4Q62445 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sp4Q62445 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sp4Q62445 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sp4Q62445 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sp4Q62445 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sp4Q62445 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sp4Q62445 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sp4Q62445 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sp4Q62445 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sp4Q62445 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sp4Q62445 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sp4Q62445 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sp4Q62445 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sp4Q62445 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sp4Q62445 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sp4Q62445 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sp4Q62445 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sp4Q62445 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sp4Q62445 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sp4Q62445 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sp4Q62445 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sp4Q62445 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sp4Q62445 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sp4Q62445 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sp4Q62445 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sp4Q62445 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sp4Q62445 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sp4Q62445 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sp4Q62445 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sp4Q62445 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sp4Q62445 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sp4Q62445 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sp4Q62445 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sp4Q62445 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sp4Q62445 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sp4Q62445 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sp4Q62445 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sp4Q62445 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sp4Q62445 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sp4Q62445 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sp4Q62445 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sp4Q62445 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sp4Q62445 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms