Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxa13Q62424 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxa13Q62424 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxa13Q62424 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxa13Q62424 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxa13Q62424 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxa13Q62424 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxa13Q62424 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxa13Q62424 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxa13Q62424 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxa13Q62424 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxa13Q62424 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxa13Q62424 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxa13Q62424 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxa13Q62424 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxa13Q62424 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxa13Q62424 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxa13Q62424 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxa13Q62424 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxa13Q62424 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxa13Q62424 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxa13Q62424 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxa13Q62424 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxa13Q62424 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxa13Q62424 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxa13Q62424 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxa13Q62424 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxa13Q62424 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxa13Q62424 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxa13Q62424 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxa13Q62424 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxa13Q62424 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxa13Q62424 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxa13Q62424 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxa13Q62424 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxa13Q62424 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxa13Q62424 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxa13Q62424 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxa13Q62424 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxa13Q62424 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxa13Q62424 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxa13Q62424 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxa13Q62424 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxa13Q62424 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxa13Q62424 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxa13Q62424 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxa13Q62424 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxa13Q62424 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxa13Q62424 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxa13Q62424 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxa13Q62424 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxa13Q62424 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxa13Q62424 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxa13Q62424 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxa13Q62424 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxa13Q62424 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxa13Q62424 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxa13Q62424 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxa13Q62424 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxa13Q62424 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxa13Q62424 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxa13Q62424 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxa13Q62424 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxa13Q62424 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxa13Q62424 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxa13Q62424 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxa13Q62424 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxa13Q62424 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxa13Q62424 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxa13Q62424 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxa13Q62424 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxa13Q62424 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxa13Q62424 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxa13Q62424 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxa13Q62424 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxa13Q62424 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxa13Q62424 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxa13Q62424 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxa13Q62424 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxa13Q62424 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxa13Q62424 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxa13Q62424 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxa13Q62424 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxa13Q62424 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxa13Q62424 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxa13Q62424 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxa13Q62424 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxa13Q62424 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxa13Q62424 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxa13Q62424 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxa13Q62424 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxa13Q62424 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxa13Q62424 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxa13Q62424 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxa13Q62424 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxa13Q62424 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxa13Q62424 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxa13Q62424 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxa13Q62424 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxa13Q62424 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms