Protein–RNA interactions for Protein: Q62395

Tff3, Trefoil factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff3Q62395 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tff3Q62395 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tff3Q62395 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tff3Q62395 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tff3Q62395 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tff3Q62395 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tff3Q62395 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tff3Q62395 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tff3Q62395 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tff3Q62395 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tff3Q62395 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tff3Q62395 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tff3Q62395 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tff3Q62395 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tff3Q62395 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tff3Q62395 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tff3Q62395 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tff3Q62395 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tff3Q62395 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tff3Q62395 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Tff3Q62395 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tff3Q62395 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tff3Q62395 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tff3Q62395 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tff3Q62395 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tff3Q62395 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tff3Q62395 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tff3Q62395 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tff3Q62395 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tff3Q62395 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tff3Q62395 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tff3Q62395 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tff3Q62395 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tff3Q62395 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tff3Q62395 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Tff3Q62395 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tff3Q62395 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tff3Q62395 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tff3Q62395 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tff3Q62395 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tff3Q62395 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tff3Q62395 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tff3Q62395 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tff3Q62395 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tff3Q62395 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tff3Q62395 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tff3Q62395 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tff3Q62395 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tff3Q62395 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tff3Q62395 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tff3Q62395 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tff3Q62395 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tff3Q62395 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tff3Q62395 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tff3Q62395 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tff3Q62395 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tff3Q62395 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tff3Q62395 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tff3Q62395 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tff3Q62395 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tff3Q62395 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tff3Q62395 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Tff3Q62395 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tff3Q62395 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tff3Q62395 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tff3Q62395 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tff3Q62395 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Tff3Q62395 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tff3Q62395 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tff3Q62395 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Tff3Q62395 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tff3Q62395 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Tff3Q62395 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tff3Q62395 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tff3Q62395 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tff3Q62395 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tff3Q62395 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tff3Q62395 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tff3Q62395 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Tff3Q62395 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Tff3Q62395 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tff3Q62395 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tff3Q62395 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tff3Q62395 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tff3Q62395 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tff3Q62395 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tff3Q62395 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tff3Q62395 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tff3Q62395 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Tff3Q62395 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tff3Q62395 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tff3Q62395 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tff3Q62395 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tff3Q62395 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Tff3Q62395 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tff3Q62395 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tff3Q62395 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tff3Q62395 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tff3Q62395 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tff3Q62395 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms