Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ttf1Q62187 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ttf1Q62187 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ttf1Q62187 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ttf1Q62187 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ttf1Q62187 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ttf1Q62187 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ttf1Q62187 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ttf1Q62187 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ttf1Q62187 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ttf1Q62187 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ttf1Q62187 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ttf1Q62187 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ttf1Q62187 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ttf1Q62187 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ttf1Q62187 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ttf1Q62187 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ttf1Q62187 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ttf1Q62187 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ttf1Q62187 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ttf1Q62187 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ttf1Q62187 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ttf1Q62187 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ttf1Q62187 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ttf1Q62187 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ttf1Q62187 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttf1Q62187 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttf1Q62187 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttf1Q62187 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttf1Q62187 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttf1Q62187 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttf1Q62187 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttf1Q62187 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttf1Q62187 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttf1Q62187 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttf1Q62187 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttf1Q62187 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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Ttf1Q62187 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttf1Q62187 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttf1Q62187 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttf1Q62187 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttf1Q62187 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttf1Q62187 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttf1Q62187 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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Ttf1Q62187 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttf1Q62187 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttf1Q62187 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttf1Q62187 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttf1Q62187 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttf1Q62187 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttf1Q62187 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttf1Q62187 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttf1Q62187 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttf1Q62187 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttf1Q62187 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttf1Q62187 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttf1Q62187 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttf1Q62187 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttf1Q62187 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
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Ttf1Q62187 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttf1Q62187 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttf1Q62187 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttf1Q62187 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttf1Q62187 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttf1Q62187 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttf1Q62187 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttf1Q62187 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttf1Q62187 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttf1Q62187 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttf1Q62187 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttf1Q62187 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ttf1Q62187 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ttf1Q62187 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ttf1Q62187 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ttf1Q62187 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ttf1Q62187 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ttf1Q62187 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ttf1Q62187 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Ttf1Q62187 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ttf1Q62187 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ttf1Q62187 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ttf1Q62187 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ttf1Q62187 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ttf1Q62187 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttf1Q62187 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttf1Q62187 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttf1Q62187 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttf1Q62187 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttf1Q62187 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttf1Q62187 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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