Protein–RNA interactions for Protein: Q62018

Ctr9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctr9Q62018 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ctr9Q62018 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ctr9Q62018 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ctr9Q62018 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ctr9Q62018 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ctr9Q62018 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ctr9Q62018 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ctr9Q62018 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ctr9Q62018 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ctr9Q62018 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ctr9Q62018 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ctr9Q62018 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ctr9Q62018 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ctr9Q62018 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ctr9Q62018 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ctr9Q62018 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ctr9Q62018 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ctr9Q62018 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ctr9Q62018 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ctr9Q62018 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ctr9Q62018 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ctr9Q62018 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ctr9Q62018 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ctr9Q62018 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ctr9Q62018 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ctr9Q62018 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ctr9Q62018 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ctr9Q62018 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ctr9Q62018 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ctr9Q62018 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ctr9Q62018 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ctr9Q62018 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ctr9Q62018 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ctr9Q62018 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ctr9Q62018 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ctr9Q62018 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ctr9Q62018 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ctr9Q62018 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ctr9Q62018 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ctr9Q62018 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ctr9Q62018 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ctr9Q62018 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ctr9Q62018 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ctr9Q62018 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ctr9Q62018 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ctr9Q62018 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ctr9Q62018 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ctr9Q62018 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ctr9Q62018 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ctr9Q62018 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ctr9Q62018 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ctr9Q62018 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ctr9Q62018 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ctr9Q62018 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ctr9Q62018 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ctr9Q62018 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ctr9Q62018 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ctr9Q62018 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ctr9Q62018 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ctr9Q62018 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ctr9Q62018 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ctr9Q62018 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ctr9Q62018 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ctr9Q62018 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ctr9Q62018 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ctr9Q62018 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ctr9Q62018 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ctr9Q62018 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ctr9Q62018 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ctr9Q62018 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ctr9Q62018 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ctr9Q62018 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ctr9Q62018 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ctr9Q62018 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ctr9Q62018 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ctr9Q62018 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ctr9Q62018 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ctr9Q62018 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ctr9Q62018 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ctr9Q62018 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ctr9Q62018 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ctr9Q62018 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ctr9Q62018 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ctr9Q62018 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ctr9Q62018 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ctr9Q62018 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ctr9Q62018 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ctr9Q62018 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ctr9Q62018 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ctr9Q62018 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ctr9Q62018 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ctr9Q62018 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ctr9Q62018 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ctr9Q62018 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ctr9Q62018 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ctr9Q62018 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ctr9Q62018 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ctr9Q62018 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ctr9Q62018 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ctr9Q62018 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms