Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AtrxQ61687 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AtrxQ61687 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
AtrxQ61687 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
AtrxQ61687 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
AtrxQ61687 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
AtrxQ61687 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
AtrxQ61687 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AtrxQ61687 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AtrxQ61687 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AtrxQ61687 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AtrxQ61687 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AtrxQ61687 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
AtrxQ61687 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AtrxQ61687 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AtrxQ61687 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AtrxQ61687 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AtrxQ61687 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AtrxQ61687 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AtrxQ61687 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AtrxQ61687 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AtrxQ61687 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AtrxQ61687 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AtrxQ61687 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AtrxQ61687 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AtrxQ61687 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AtrxQ61687 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AtrxQ61687 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AtrxQ61687 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AtrxQ61687 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AtrxQ61687 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AtrxQ61687 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AtrxQ61687 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AtrxQ61687 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AtrxQ61687 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AtrxQ61687 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AtrxQ61687 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AtrxQ61687 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AtrxQ61687 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AtrxQ61687 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AtrxQ61687 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AtrxQ61687 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AtrxQ61687 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AtrxQ61687 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
AtrxQ61687 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AtrxQ61687 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AtrxQ61687 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
AtrxQ61687 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AtrxQ61687 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AtrxQ61687 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AtrxQ61687 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AtrxQ61687 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AtrxQ61687 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AtrxQ61687 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AtrxQ61687 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AtrxQ61687 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AtrxQ61687 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AtrxQ61687 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AtrxQ61687 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AtrxQ61687 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AtrxQ61687 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AtrxQ61687 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AtrxQ61687 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
AtrxQ61687 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AtrxQ61687 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
AtrxQ61687 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AtrxQ61687 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
AtrxQ61687 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
AtrxQ61687 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
AtrxQ61687 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
AtrxQ61687 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AtrxQ61687 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AtrxQ61687 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AtrxQ61687 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AtrxQ61687 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AtrxQ61687 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AtrxQ61687 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AtrxQ61687 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AtrxQ61687 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AtrxQ61687 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AtrxQ61687 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AtrxQ61687 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AtrxQ61687 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AtrxQ61687 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AtrxQ61687 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AtrxQ61687 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AtrxQ61687 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AtrxQ61687 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AtrxQ61687 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AtrxQ61687 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
AtrxQ61687 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AtrxQ61687 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AtrxQ61687 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AtrxQ61687 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AtrxQ61687 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AtrxQ61687 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AtrxQ61687 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AtrxQ61687 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AtrxQ61687 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
AtrxQ61687 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms