Protein–RNA interactions for Protein: Q61371

Ift88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift88Q61371 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ift88Q61371 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ift88Q61371 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ift88Q61371 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ift88Q61371 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ift88Q61371 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ift88Q61371 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ift88Q61371 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ift88Q61371 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ift88Q61371 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ift88Q61371 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ift88Q61371 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ift88Q61371 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ift88Q61371 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ift88Q61371 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ift88Q61371 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ift88Q61371 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ift88Q61371 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ift88Q61371 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ift88Q61371 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ift88Q61371 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ift88Q61371 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ift88Q61371 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ift88Q61371 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ift88Q61371 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ift88Q61371 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ift88Q61371 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ift88Q61371 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ift88Q61371 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ift88Q61371 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ift88Q61371 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ift88Q61371 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ift88Q61371 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ift88Q61371 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ift88Q61371 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ift88Q61371 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ift88Q61371 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ift88Q61371 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ift88Q61371 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ift88Q61371 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ift88Q61371 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ift88Q61371 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ift88Q61371 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ift88Q61371 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ift88Q61371 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ift88Q61371 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ift88Q61371 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ift88Q61371 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ift88Q61371 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ift88Q61371 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ift88Q61371 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ift88Q61371 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ift88Q61371 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ift88Q61371 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ift88Q61371 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ift88Q61371 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ift88Q61371 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ift88Q61371 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ift88Q61371 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ift88Q61371 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ift88Q61371 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ift88Q61371 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ift88Q61371 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ift88Q61371 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ift88Q61371 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ift88Q61371 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ift88Q61371 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ift88Q61371 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ift88Q61371 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ift88Q61371 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ift88Q61371 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ift88Q61371 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ift88Q61371 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ift88Q61371 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ift88Q61371 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ift88Q61371 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ift88Q61371 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ift88Q61371 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ift88Q61371 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ift88Q61371 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ift88Q61371 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ift88Q61371 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ift88Q61371 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ift88Q61371 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ift88Q61371 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ift88Q61371 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ift88Q61371 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ift88Q61371 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ift88Q61371 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ift88Q61371 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ift88Q61371 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ift88Q61371 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ift88Q61371 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ift88Q61371 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ift88Q61371 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ift88Q61371 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ift88Q61371 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ift88Q61371 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ift88Q61371 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ift88Q61371 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms