Protein–RNA interactions for Protein: Q61060

Foxd3, Forkhead box protein D3, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd3Q61060 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Foxd3Q61060 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Foxd3Q61060 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Foxd3Q61060 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Foxd3Q61060 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Foxd3Q61060 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Foxd3Q61060 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Foxd3Q61060 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Foxd3Q61060 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Foxd3Q61060 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Foxd3Q61060 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Foxd3Q61060 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Foxd3Q61060 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Foxd3Q61060 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Foxd3Q61060 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Foxd3Q61060 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Foxd3Q61060 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Foxd3Q61060 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Foxd3Q61060 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Foxd3Q61060 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Foxd3Q61060 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Foxd3Q61060 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Foxd3Q61060 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Foxd3Q61060 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Foxd3Q61060 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Foxd3Q61060 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Foxd3Q61060 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Foxd3Q61060 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Foxd3Q61060 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Foxd3Q61060 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Foxd3Q61060 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Foxd3Q61060 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Foxd3Q61060 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Foxd3Q61060 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Foxd3Q61060 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Foxd3Q61060 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Foxd3Q61060 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Foxd3Q61060 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Foxd3Q61060 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Foxd3Q61060 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Foxd3Q61060 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Foxd3Q61060 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Foxd3Q61060 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Foxd3Q61060 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Foxd3Q61060 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Foxd3Q61060 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Foxd3Q61060 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Foxd3Q61060 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Foxd3Q61060 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Foxd3Q61060 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Foxd3Q61060 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Foxd3Q61060 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Foxd3Q61060 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Foxd3Q61060 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Foxd3Q61060 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Foxd3Q61060 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Foxd3Q61060 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Foxd3Q61060 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Foxd3Q61060 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Foxd3Q61060 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Foxd3Q61060 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Foxd3Q61060 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Foxd3Q61060 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Foxd3Q61060 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Foxd3Q61060 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Foxd3Q61060 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Foxd3Q61060 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Foxd3Q61060 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Foxd3Q61060 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Foxd3Q61060 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Foxd3Q61060 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Foxd3Q61060 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Foxd3Q61060 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Foxd3Q61060 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Foxd3Q61060 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Foxd3Q61060 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Foxd3Q61060 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Foxd3Q61060 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Foxd3Q61060 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Foxd3Q61060 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Foxd3Q61060 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Foxd3Q61060 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Foxd3Q61060 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Foxd3Q61060 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Foxd3Q61060 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Foxd3Q61060 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Foxd3Q61060 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Foxd3Q61060 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Foxd3Q61060 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Foxd3Q61060 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Foxd3Q61060 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Foxd3Q61060 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Foxd3Q61060 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Foxd3Q61060 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Foxd3Q61060 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Foxd3Q61060 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Foxd3Q61060 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Foxd3Q61060 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Foxd3Q61060 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Foxd3Q61060 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms