Protein–RNA interactions for Protein: Q61043

Nin, Ninein, mousemouse

Predictions only

Length 2,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinQ61043 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NinQ61043 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NinQ61043 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NinQ61043 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NinQ61043 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NinQ61043 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NinQ61043 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NinQ61043 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NinQ61043 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NinQ61043 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NinQ61043 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NinQ61043 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NinQ61043 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NinQ61043 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NinQ61043 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
NinQ61043 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NinQ61043 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NinQ61043 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NinQ61043 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NinQ61043 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NinQ61043 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NinQ61043 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NinQ61043 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NinQ61043 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NinQ61043 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NinQ61043 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NinQ61043 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NinQ61043 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NinQ61043 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NinQ61043 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NinQ61043 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NinQ61043 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NinQ61043 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NinQ61043 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NinQ61043 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NinQ61043 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NinQ61043 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NinQ61043 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NinQ61043 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NinQ61043 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NinQ61043 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NinQ61043 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NinQ61043 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NinQ61043 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NinQ61043 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NinQ61043 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NinQ61043 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NinQ61043 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NinQ61043 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NinQ61043 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NinQ61043 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NinQ61043 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NinQ61043 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NinQ61043 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NinQ61043 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NinQ61043 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NinQ61043 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NinQ61043 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NinQ61043 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NinQ61043 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NinQ61043 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NinQ61043 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NinQ61043 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NinQ61043 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NinQ61043 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NinQ61043 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NinQ61043 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NinQ61043 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NinQ61043 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NinQ61043 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NinQ61043 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NinQ61043 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NinQ61043 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NinQ61043 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NinQ61043 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NinQ61043 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NinQ61043 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NinQ61043 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NinQ61043 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NinQ61043 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NinQ61043 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NinQ61043 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NinQ61043 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NinQ61043 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NinQ61043 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NinQ61043 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NinQ61043 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NinQ61043 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NinQ61043 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NinQ61043 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NinQ61043 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NinQ61043 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NinQ61043 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NinQ61043 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NinQ61043 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NinQ61043 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NinQ61043 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NinQ61043 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NinQ61043 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NinQ61043 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms