Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
JrkQ60976 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
JrkQ60976 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
JrkQ60976 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
JrkQ60976 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
JrkQ60976 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
JrkQ60976 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
JrkQ60976 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
JrkQ60976 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
JrkQ60976 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
JrkQ60976 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
JrkQ60976 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
JrkQ60976 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
JrkQ60976 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
JrkQ60976 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
JrkQ60976 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
JrkQ60976 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
JrkQ60976 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
JrkQ60976 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
JrkQ60976 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
JrkQ60976 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
JrkQ60976 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
JrkQ60976 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
JrkQ60976 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
JrkQ60976 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
JrkQ60976 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
JrkQ60976 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
JrkQ60976 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
JrkQ60976 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
JrkQ60976 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
JrkQ60976 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
JrkQ60976 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
JrkQ60976 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
JrkQ60976 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
JrkQ60976 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
JrkQ60976 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
JrkQ60976 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
JrkQ60976 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
JrkQ60976 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
JrkQ60976 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
JrkQ60976 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
JrkQ60976 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
JrkQ60976 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
JrkQ60976 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
JrkQ60976 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
JrkQ60976 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
JrkQ60976 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
JrkQ60976 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
JrkQ60976 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
JrkQ60976 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
JrkQ60976 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
JrkQ60976 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
JrkQ60976 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
JrkQ60976 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
JrkQ60976 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
JrkQ60976 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
JrkQ60976 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
JrkQ60976 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
JrkQ60976 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
JrkQ60976 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
JrkQ60976 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
JrkQ60976 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
JrkQ60976 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
JrkQ60976 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
JrkQ60976 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
JrkQ60976 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
JrkQ60976 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
JrkQ60976 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
JrkQ60976 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
JrkQ60976 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
JrkQ60976 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
JrkQ60976 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
JrkQ60976 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
JrkQ60976 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
JrkQ60976 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
JrkQ60976 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
JrkQ60976 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
JrkQ60976 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
JrkQ60976 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
JrkQ60976 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
JrkQ60976 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
JrkQ60976 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
JrkQ60976 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
JrkQ60976 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
JrkQ60976 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
JrkQ60976 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
JrkQ60976 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
JrkQ60976 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
JrkQ60976 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
JrkQ60976 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
JrkQ60976 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
JrkQ60976 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
JrkQ60976 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
JrkQ60976 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
JrkQ60976 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
JrkQ60976 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
JrkQ60976 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
JrkQ60976 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
JrkQ60976 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
JrkQ60976 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms