Protein–RNA interactions for Protein: Q60954

Meis1, Homeobox protein Meis1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis1Q60954 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Meis1Q60954 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Meis1Q60954 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Meis1Q60954 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Meis1Q60954 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Meis1Q60954 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Meis1Q60954 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Meis1Q60954 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Meis1Q60954 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Meis1Q60954 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Meis1Q60954 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Meis1Q60954 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Meis1Q60954 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Meis1Q60954 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Meis1Q60954 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Meis1Q60954 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Meis1Q60954 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Meis1Q60954 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Meis1Q60954 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Meis1Q60954 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Meis1Q60954 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Meis1Q60954 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Meis1Q60954 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Meis1Q60954 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Meis1Q60954 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Meis1Q60954 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Meis1Q60954 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Meis1Q60954 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Meis1Q60954 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Meis1Q60954 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Meis1Q60954 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Meis1Q60954 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Meis1Q60954 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Meis1Q60954 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Meis1Q60954 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Meis1Q60954 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Meis1Q60954 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Meis1Q60954 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Meis1Q60954 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Meis1Q60954 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Meis1Q60954 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Meis1Q60954 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Meis1Q60954 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Meis1Q60954 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Meis1Q60954 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Meis1Q60954 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Meis1Q60954 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Meis1Q60954 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Meis1Q60954 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Meis1Q60954 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Meis1Q60954 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Meis1Q60954 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Meis1Q60954 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Meis1Q60954 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Meis1Q60954 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Meis1Q60954 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Meis1Q60954 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Meis1Q60954 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Meis1Q60954 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Meis1Q60954 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Meis1Q60954 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Meis1Q60954 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Meis1Q60954 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Meis1Q60954 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Meis1Q60954 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Meis1Q60954 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Meis1Q60954 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Meis1Q60954 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Meis1Q60954 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Meis1Q60954 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Meis1Q60954 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Meis1Q60954 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Meis1Q60954 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Meis1Q60954 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Meis1Q60954 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Meis1Q60954 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Meis1Q60954 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Meis1Q60954 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Meis1Q60954 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Meis1Q60954 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Meis1Q60954 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Meis1Q60954 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Meis1Q60954 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Meis1Q60954 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Meis1Q60954 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Meis1Q60954 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Meis1Q60954 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Meis1Q60954 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Meis1Q60954 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Meis1Q60954 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Meis1Q60954 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Meis1Q60954 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Meis1Q60954 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Meis1Q60954 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Meis1Q60954 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Meis1Q60954 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Meis1Q60954 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Meis1Q60954 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Meis1Q60954 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Meis1Q60954 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms