Protein–RNA interactions for Protein: Q60925

Dbp, D site-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbpQ60925 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DbpQ60925 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DbpQ60925 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
DbpQ60925 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DbpQ60925 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DbpQ60925 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DbpQ60925 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DbpQ60925 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DbpQ60925 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DbpQ60925 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DbpQ60925 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DbpQ60925 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DbpQ60925 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DbpQ60925 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DbpQ60925 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DbpQ60925 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DbpQ60925 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DbpQ60925 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DbpQ60925 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DbpQ60925 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DbpQ60925 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DbpQ60925 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DbpQ60925 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DbpQ60925 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DbpQ60925 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DbpQ60925 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DbpQ60925 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DbpQ60925 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DbpQ60925 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DbpQ60925 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DbpQ60925 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
DbpQ60925 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DbpQ60925 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DbpQ60925 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
DbpQ60925 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DbpQ60925 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DbpQ60925 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DbpQ60925 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DbpQ60925 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DbpQ60925 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DbpQ60925 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DbpQ60925 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DbpQ60925 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
DbpQ60925 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DbpQ60925 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DbpQ60925 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DbpQ60925 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DbpQ60925 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DbpQ60925 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DbpQ60925 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DbpQ60925 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DbpQ60925 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DbpQ60925 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
DbpQ60925 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
DbpQ60925 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DbpQ60925 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DbpQ60925 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DbpQ60925 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DbpQ60925 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DbpQ60925 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DbpQ60925 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DbpQ60925 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DbpQ60925 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DbpQ60925 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DbpQ60925 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DbpQ60925 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DbpQ60925 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DbpQ60925 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DbpQ60925 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DbpQ60925 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DbpQ60925 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DbpQ60925 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DbpQ60925 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DbpQ60925 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DbpQ60925 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DbpQ60925 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DbpQ60925 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DbpQ60925 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DbpQ60925 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DbpQ60925 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DbpQ60925 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DbpQ60925 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DbpQ60925 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DbpQ60925 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DbpQ60925 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DbpQ60925 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DbpQ60925 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DbpQ60925 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DbpQ60925 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DbpQ60925 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DbpQ60925 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DbpQ60925 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DbpQ60925 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DbpQ60925 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DbpQ60925 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DbpQ60925 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DbpQ60925 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DbpQ60925 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DbpQ60925 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DbpQ60925 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms