Protein–RNA interactions for Protein: Q60854

Serpinb6, Serpin B6, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpinb6Q60854 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Serpinb6Q60854 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Serpinb6Q60854 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Serpinb6Q60854 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Serpinb6Q60854 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Serpinb6Q60854 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Serpinb6Q60854 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Serpinb6Q60854 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Serpinb6Q60854 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Serpinb6Q60854 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Serpinb6Q60854 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Serpinb6Q60854 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Serpinb6Q60854 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Serpinb6Q60854 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Serpinb6Q60854 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Serpinb6Q60854 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Serpinb6Q60854 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Serpinb6Q60854 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Serpinb6Q60854 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Serpinb6Q60854 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Serpinb6Q60854 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Serpinb6Q60854 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Serpinb6Q60854 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Serpinb6Q60854 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Serpinb6Q60854 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Serpinb6Q60854 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Serpinb6Q60854 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Serpinb6Q60854 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Serpinb6Q60854 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Serpinb6Q60854 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Serpinb6Q60854 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Serpinb6Q60854 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Serpinb6Q60854 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Serpinb6Q60854 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Serpinb6Q60854 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Serpinb6Q60854 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Serpinb6Q60854 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Serpinb6Q60854 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Serpinb6Q60854 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Serpinb6Q60854 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Serpinb6Q60854 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Serpinb6Q60854 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Serpinb6Q60854 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Serpinb6Q60854 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Serpinb6Q60854 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Serpinb6Q60854 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Serpinb6Q60854 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Serpinb6Q60854 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Serpinb6Q60854 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Serpinb6Q60854 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Serpinb6Q60854 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Serpinb6Q60854 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Serpinb6Q60854 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Serpinb6Q60854 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Serpinb6Q60854 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Serpinb6Q60854 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Serpinb6Q60854 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Serpinb6Q60854 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Serpinb6Q60854 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Serpinb6Q60854 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Serpinb6Q60854 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Serpinb6Q60854 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Serpinb6Q60854 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Serpinb6Q60854 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Serpinb6Q60854 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Serpinb6Q60854 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Serpinb6Q60854 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Serpinb6Q60854 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Serpinb6Q60854 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Serpinb6Q60854 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Serpinb6Q60854 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Serpinb6Q60854 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Serpinb6Q60854 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Serpinb6Q60854 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Serpinb6Q60854 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Serpinb6Q60854 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Serpinb6Q60854 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Serpinb6Q60854 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Serpinb6Q60854 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Serpinb6Q60854 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Serpinb6Q60854 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Serpinb6Q60854 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Serpinb6Q60854 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Serpinb6Q60854 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Serpinb6Q60854 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Serpinb6Q60854 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Serpinb6Q60854 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Serpinb6Q60854 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Serpinb6Q60854 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Serpinb6Q60854 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Serpinb6Q60854 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Serpinb6Q60854 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Serpinb6Q60854 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Serpinb6Q60854 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Serpinb6Q60854 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Serpinb6Q60854 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Serpinb6Q60854 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Serpinb6Q60854 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Serpinb6Q60854 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Serpinb6Q60854 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms