Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Cnot7Q60809 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Cnot7Q60809 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cnot7Q60809 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cnot7Q60809 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cnot7Q60809 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cnot7Q60809 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cnot7Q60809 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cnot7Q60809 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Cnot7Q60809 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cnot7Q60809 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cnot7Q60809 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cnot7Q60809 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cnot7Q60809 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cnot7Q60809 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cnot7Q60809 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cnot7Q60809 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cnot7Q60809 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cnot7Q60809 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cnot7Q60809 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cnot7Q60809 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cnot7Q60809 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cnot7Q60809 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cnot7Q60809 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cnot7Q60809 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cnot7Q60809 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cnot7Q60809 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cnot7Q60809 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cnot7Q60809 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cnot7Q60809 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cnot7Q60809 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cnot7Q60809 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cnot7Q60809 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Cnot7Q60809 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Cnot7Q60809 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cnot7Q60809 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cnot7Q60809 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cnot7Q60809 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cnot7Q60809 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cnot7Q60809 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cnot7Q60809 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Cnot7Q60809 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Cnot7Q60809 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cnot7Q60809 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cnot7Q60809 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cnot7Q60809 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cnot7Q60809 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cnot7Q60809 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cnot7Q60809 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cnot7Q60809 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cnot7Q60809 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cnot7Q60809 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Cnot7Q60809 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Cnot7Q60809 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cnot7Q60809 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cnot7Q60809 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cnot7Q60809 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cnot7Q60809 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cnot7Q60809 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cnot7Q60809 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cnot7Q60809 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cnot7Q60809 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cnot7Q60809 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cnot7Q60809 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cnot7Q60809 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cnot7Q60809 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cnot7Q60809 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cnot7Q60809 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cnot7Q60809 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cnot7Q60809 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cnot7Q60809 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cnot7Q60809 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cnot7Q60809 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cnot7Q60809 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cnot7Q60809 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cnot7Q60809 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Cnot7Q60809 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cnot7Q60809 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cnot7Q60809 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cnot7Q60809 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cnot7Q60809 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cnot7Q60809 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cnot7Q60809 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cnot7Q60809 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cnot7Q60809 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cnot7Q60809 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cnot7Q60809 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cnot7Q60809 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cnot7Q60809 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cnot7Q60809 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cnot7Q60809 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cnot7Q60809 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cnot7Q60809 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Cnot7Q60809 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cnot7Q60809 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Cnot7Q60809 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cnot7Q60809 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cnot7Q60809 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cnot7Q60809 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cnot7Q60809 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms