Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Atf3Q60765 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Atf3Q60765 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Atf3Q60765 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Atf3Q60765 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Atf3Q60765 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Atf3Q60765 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Atf3Q60765 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Atf3Q60765 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Atf3Q60765 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Atf3Q60765 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Atf3Q60765 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Atf3Q60765 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Atf3Q60765 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Atf3Q60765 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Atf3Q60765 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Atf3Q60765 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Atf3Q60765 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Atf3Q60765 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Atf3Q60765 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Atf3Q60765 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Atf3Q60765 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Atf3Q60765 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Atf3Q60765 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Atf3Q60765 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Atf3Q60765 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Atf3Q60765 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Atf3Q60765 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Atf3Q60765 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Atf3Q60765 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Atf3Q60765 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Atf3Q60765 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Atf3Q60765 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Atf3Q60765 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Atf3Q60765 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Atf3Q60765 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Atf3Q60765 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Atf3Q60765 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Atf3Q60765 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Atf3Q60765 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Atf3Q60765 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Atf3Q60765 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Atf3Q60765 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Atf3Q60765 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Atf3Q60765 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Atf3Q60765 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Atf3Q60765 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Atf3Q60765 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Atf3Q60765 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Atf3Q60765 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Atf3Q60765 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Atf3Q60765 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Atf3Q60765 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Atf3Q60765 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Atf3Q60765 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Atf3Q60765 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Atf3Q60765 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Atf3Q60765 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Atf3Q60765 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Atf3Q60765 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Atf3Q60765 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Atf3Q60765 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Atf3Q60765 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Atf3Q60765 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Atf3Q60765 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Atf3Q60765 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Atf3Q60765 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Atf3Q60765 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Atf3Q60765 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Atf3Q60765 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Atf3Q60765 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Atf3Q60765 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Atf3Q60765 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Atf3Q60765 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Atf3Q60765 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Atf3Q60765 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Atf3Q60765 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Atf3Q60765 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Atf3Q60765 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Atf3Q60765 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Atf3Q60765 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Atf3Q60765 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Atf3Q60765 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Atf3Q60765 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atf3Q60765 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atf3Q60765 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atf3Q60765 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atf3Q60765 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Atf3Q60765 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Atf3Q60765 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Atf3Q60765 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Atf3Q60765 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Atf3Q60765 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Atf3Q60765 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Atf3Q60765 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Atf3Q60765 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Atf3Q60765 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atf3Q60765 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atf3Q60765 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atf3Q60765 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms