Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Foxd4Q60688 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Foxd4Q60688 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Foxd4Q60688 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Foxd4Q60688 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Foxd4Q60688 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Foxd4Q60688 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Foxd4Q60688 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Foxd4Q60688 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Foxd4Q60688 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Foxd4Q60688 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Foxd4Q60688 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Foxd4Q60688 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Foxd4Q60688 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Foxd4Q60688 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Foxd4Q60688 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Foxd4Q60688 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Foxd4Q60688 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Foxd4Q60688 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Foxd4Q60688 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Foxd4Q60688 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Foxd4Q60688 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Foxd4Q60688 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Foxd4Q60688 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Foxd4Q60688 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Foxd4Q60688 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Foxd4Q60688 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Foxd4Q60688 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Foxd4Q60688 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Foxd4Q60688 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Foxd4Q60688 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Foxd4Q60688 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Foxd4Q60688 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Foxd4Q60688 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Foxd4Q60688 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Foxd4Q60688 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Foxd4Q60688 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Foxd4Q60688 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Foxd4Q60688 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Foxd4Q60688 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Foxd4Q60688 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Foxd4Q60688 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Foxd4Q60688 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Foxd4Q60688 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Foxd4Q60688 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Foxd4Q60688 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Foxd4Q60688 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Foxd4Q60688 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Foxd4Q60688 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Foxd4Q60688 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Foxd4Q60688 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Foxd4Q60688 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Foxd4Q60688 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Foxd4Q60688 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Foxd4Q60688 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Foxd4Q60688 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Foxd4Q60688 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Foxd4Q60688 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Foxd4Q60688 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Foxd4Q60688 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Foxd4Q60688 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Foxd4Q60688 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Foxd4Q60688 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Foxd4Q60688 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Foxd4Q60688 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Foxd4Q60688 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Foxd4Q60688 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Foxd4Q60688 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Foxd4Q60688 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Foxd4Q60688 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Foxd4Q60688 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Foxd4Q60688 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Foxd4Q60688 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Foxd4Q60688 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Foxd4Q60688 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Foxd4Q60688 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Foxd4Q60688 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Foxd4Q60688 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Foxd4Q60688 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Foxd4Q60688 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Foxd4Q60688 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Foxd4Q60688 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Foxd4Q60688 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Foxd4Q60688 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Foxd4Q60688 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Foxd4Q60688 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Foxd4Q60688 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Foxd4Q60688 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Foxd4Q60688 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Foxd4Q60688 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Foxd4Q60688 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Foxd4Q60688 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Foxd4Q60688 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Foxd4Q60688 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Foxd4Q60688 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Foxd4Q60688 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Foxd4Q60688 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Foxd4Q60688 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Foxd4Q60688 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Foxd4Q60688 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms