Protein–RNA interactions for Protein: Q60670

Sik1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik1Q60670 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Sik1Q60670 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sik1Q60670 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sik1Q60670 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sik1Q60670 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Sik1Q60670 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Sik1Q60670 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Sik1Q60670 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sik1Q60670 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sik1Q60670 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sik1Q60670 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Sik1Q60670 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sik1Q60670 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sik1Q60670 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sik1Q60670 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sik1Q60670 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sik1Q60670 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Sik1Q60670 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sik1Q60670 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sik1Q60670 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sik1Q60670 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sik1Q60670 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sik1Q60670 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sik1Q60670 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sik1Q60670 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Sik1Q60670 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sik1Q60670 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sik1Q60670 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Sik1Q60670 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Sik1Q60670 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Sik1Q60670 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Sik1Q60670 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sik1Q60670 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sik1Q60670 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sik1Q60670 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sik1Q60670 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sik1Q60670 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sik1Q60670 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sik1Q60670 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sik1Q60670 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sik1Q60670 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sik1Q60670 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sik1Q60670 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sik1Q60670 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sik1Q60670 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Sik1Q60670 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sik1Q60670 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sik1Q60670 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sik1Q60670 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sik1Q60670 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Sik1Q60670 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sik1Q60670 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sik1Q60670 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sik1Q60670 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sik1Q60670 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Sik1Q60670 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sik1Q60670 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sik1Q60670 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sik1Q60670 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sik1Q60670 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sik1Q60670 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sik1Q60670 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sik1Q60670 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sik1Q60670 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sik1Q60670 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sik1Q60670 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sik1Q60670 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sik1Q60670 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sik1Q60670 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Sik1Q60670 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sik1Q60670 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sik1Q60670 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sik1Q60670 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sik1Q60670 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sik1Q60670 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sik1Q60670 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sik1Q60670 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Sik1Q60670 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sik1Q60670 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Sik1Q60670 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Sik1Q60670 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sik1Q60670 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sik1Q60670 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sik1Q60670 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sik1Q60670 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sik1Q60670 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Sik1Q60670 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sik1Q60670 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sik1Q60670 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sik1Q60670 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sik1Q60670 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sik1Q60670 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sik1Q60670 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sik1Q60670 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sik1Q60670 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sik1Q60670 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sik1Q60670 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sik1Q60670 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sik1Q60670 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sik1Q60670 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms