Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
CttnQ60598 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CttnQ60598 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CttnQ60598 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CttnQ60598 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CttnQ60598 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CttnQ60598 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CttnQ60598 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CttnQ60598 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CttnQ60598 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CttnQ60598 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CttnQ60598 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CttnQ60598 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CttnQ60598 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CttnQ60598 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CttnQ60598 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CttnQ60598 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CttnQ60598 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CttnQ60598 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CttnQ60598 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CttnQ60598 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CttnQ60598 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CttnQ60598 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CttnQ60598 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CttnQ60598 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CttnQ60598 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CttnQ60598 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CttnQ60598 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CttnQ60598 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CttnQ60598 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CttnQ60598 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CttnQ60598 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CttnQ60598 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CttnQ60598 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CttnQ60598 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CttnQ60598 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CttnQ60598 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CttnQ60598 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CttnQ60598 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CttnQ60598 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CttnQ60598 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CttnQ60598 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CttnQ60598 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CttnQ60598 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CttnQ60598 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CttnQ60598 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CttnQ60598 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CttnQ60598 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CttnQ60598 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CttnQ60598 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CttnQ60598 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CttnQ60598 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CttnQ60598 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CttnQ60598 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CttnQ60598 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CttnQ60598 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CttnQ60598 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CttnQ60598 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CttnQ60598 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CttnQ60598 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CttnQ60598 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CttnQ60598 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CttnQ60598 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CttnQ60598 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CttnQ60598 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CttnQ60598 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CttnQ60598 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CttnQ60598 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CttnQ60598 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CttnQ60598 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CttnQ60598 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CttnQ60598 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CttnQ60598 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CttnQ60598 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CttnQ60598 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CttnQ60598 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CttnQ60598 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CttnQ60598 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CttnQ60598 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CttnQ60598 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CttnQ60598 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CttnQ60598 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CttnQ60598 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CttnQ60598 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CttnQ60598 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CttnQ60598 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CttnQ60598 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CttnQ60598 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CttnQ60598 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CttnQ60598 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CttnQ60598 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CttnQ60598 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CttnQ60598 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CttnQ60598 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CttnQ60598 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CttnQ60598 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CttnQ60598 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CttnQ60598 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CttnQ60598 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CttnQ60598 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms