Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG71

Utp20, Small subunit processome component 20 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp20Q5XG71 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Utp20Q5XG71 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Utp20Q5XG71 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Utp20Q5XG71 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Utp20Q5XG71 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Utp20Q5XG71 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Utp20Q5XG71 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Utp20Q5XG71 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Utp20Q5XG71 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Utp20Q5XG71 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Utp20Q5XG71 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Utp20Q5XG71 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Utp20Q5XG71 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Utp20Q5XG71 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Utp20Q5XG71 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Utp20Q5XG71 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Utp20Q5XG71 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Utp20Q5XG71 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Utp20Q5XG71 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Utp20Q5XG71 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Utp20Q5XG71 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Utp20Q5XG71 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Utp20Q5XG71 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Utp20Q5XG71 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Utp20Q5XG71 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Utp20Q5XG71 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Utp20Q5XG71 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Utp20Q5XG71 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Utp20Q5XG71 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Utp20Q5XG71 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Utp20Q5XG71 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Utp20Q5XG71 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Utp20Q5XG71 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Utp20Q5XG71 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Utp20Q5XG71 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Utp20Q5XG71 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Utp20Q5XG71 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Utp20Q5XG71 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Utp20Q5XG71 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Utp20Q5XG71 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Utp20Q5XG71 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Utp20Q5XG71 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Utp20Q5XG71 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Utp20Q5XG71 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Utp20Q5XG71 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Utp20Q5XG71 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Utp20Q5XG71 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Utp20Q5XG71 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Utp20Q5XG71 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Utp20Q5XG71 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Utp20Q5XG71 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Utp20Q5XG71 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Utp20Q5XG71 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Utp20Q5XG71 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Utp20Q5XG71 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Utp20Q5XG71 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Utp20Q5XG71 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Utp20Q5XG71 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Utp20Q5XG71 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Utp20Q5XG71 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Utp20Q5XG71 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Utp20Q5XG71 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Utp20Q5XG71 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Utp20Q5XG71 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Utp20Q5XG71 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Utp20Q5XG71 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Utp20Q5XG71 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Utp20Q5XG71 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Utp20Q5XG71 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Utp20Q5XG71 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Utp20Q5XG71 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Utp20Q5XG71 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Utp20Q5XG71 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Utp20Q5XG71 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Utp20Q5XG71 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Utp20Q5XG71 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Utp20Q5XG71 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Utp20Q5XG71 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Utp20Q5XG71 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Utp20Q5XG71 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Utp20Q5XG71 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Utp20Q5XG71 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Utp20Q5XG71 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Utp20Q5XG71 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Utp20Q5XG71 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Utp20Q5XG71 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Utp20Q5XG71 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Utp20Q5XG71 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Utp20Q5XG71 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Utp20Q5XG71 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Utp20Q5XG71 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Utp20Q5XG71 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Utp20Q5XG71 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Utp20Q5XG71 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Utp20Q5XG71 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Utp20Q5XG71 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Utp20Q5XG71 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Utp20Q5XG71 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Utp20Q5XG71 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Utp20Q5XG71 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms