Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf15Q5UBV8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf15Q5UBV8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf15Q5UBV8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms