Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW4

Med13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13Q5SWW4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Med13Q5SWW4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Med13Q5SWW4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Med13Q5SWW4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Med13Q5SWW4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Med13Q5SWW4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Med13Q5SWW4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Med13Q5SWW4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Med13Q5SWW4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Med13Q5SWW4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Med13Q5SWW4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Med13Q5SWW4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Med13Q5SWW4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Med13Q5SWW4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Med13Q5SWW4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Med13Q5SWW4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Med13Q5SWW4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Med13Q5SWW4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Med13Q5SWW4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Med13Q5SWW4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Med13Q5SWW4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Med13Q5SWW4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Med13Q5SWW4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Med13Q5SWW4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Med13Q5SWW4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Med13Q5SWW4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Med13Q5SWW4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Med13Q5SWW4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Med13Q5SWW4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Med13Q5SWW4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Med13Q5SWW4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Med13Q5SWW4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Med13Q5SWW4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Med13Q5SWW4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Med13Q5SWW4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Med13Q5SWW4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Med13Q5SWW4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Med13Q5SWW4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Med13Q5SWW4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Med13Q5SWW4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Med13Q5SWW4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Med13Q5SWW4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Med13Q5SWW4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Med13Q5SWW4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Med13Q5SWW4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Med13Q5SWW4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Med13Q5SWW4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Med13Q5SWW4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Med13Q5SWW4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Med13Q5SWW4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Med13Q5SWW4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Med13Q5SWW4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Med13Q5SWW4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Med13Q5SWW4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Med13Q5SWW4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Med13Q5SWW4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Med13Q5SWW4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Med13Q5SWW4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Med13Q5SWW4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Med13Q5SWW4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Med13Q5SWW4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Med13Q5SWW4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Med13Q5SWW4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Med13Q5SWW4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Med13Q5SWW4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Med13Q5SWW4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Med13Q5SWW4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Med13Q5SWW4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Med13Q5SWW4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Med13Q5SWW4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Med13Q5SWW4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Med13Q5SWW4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Med13Q5SWW4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Med13Q5SWW4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Med13Q5SWW4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Med13Q5SWW4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Med13Q5SWW4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Med13Q5SWW4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Med13Q5SWW4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Med13Q5SWW4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Med13Q5SWW4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Med13Q5SWW4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Med13Q5SWW4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Med13Q5SWW4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Med13Q5SWW4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Med13Q5SWW4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Med13Q5SWW4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Med13Q5SWW4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Med13Q5SWW4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Med13Q5SWW4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Med13Q5SWW4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Med13Q5SWW4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Med13Q5SWW4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Med13Q5SWW4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Med13Q5SWW4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Med13Q5SWW4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Med13Q5SWW4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Med13Q5SWW4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Med13Q5SWW4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Med13Q5SWW4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms