Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD6

Vmn1r195, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r195Q5SVD6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r195Q5SVD6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r195Q5SVD6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r195Q5SVD6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r195Q5SVD6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r195Q5SVD6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r195Q5SVD6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r195Q5SVD6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r195Q5SVD6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r195Q5SVD6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r195Q5SVD6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r195Q5SVD6 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r195Q5SVD6 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r195Q5SVD6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r195Q5SVD6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r195Q5SVD6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r195Q5SVD6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r195Q5SVD6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r195Q5SVD6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r195Q5SVD6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r195Q5SVD6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r195Q5SVD6 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r195Q5SVD6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r195Q5SVD6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r195Q5SVD6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r195Q5SVD6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r195Q5SVD6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r195Q5SVD6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r195Q5SVD6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r195Q5SVD6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r195Q5SVD6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r195Q5SVD6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r195Q5SVD6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r195Q5SVD6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r195Q5SVD6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r195Q5SVD6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r195Q5SVD6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r195Q5SVD6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r195Q5SVD6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r195Q5SVD6 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r195Q5SVD6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r195Q5SVD6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r195Q5SVD6 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r195Q5SVD6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r195Q5SVD6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r195Q5SVD6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r195Q5SVD6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r195Q5SVD6 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r195Q5SVD6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r195Q5SVD6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r195Q5SVD6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r195Q5SVD6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r195Q5SVD6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r195Q5SVD6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r195Q5SVD6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r195Q5SVD6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r195Q5SVD6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r195Q5SVD6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r195Q5SVD6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r195Q5SVD6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r195Q5SVD6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r195Q5SVD6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r195Q5SVD6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r195Q5SVD6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r195Q5SVD6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r195Q5SVD6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r195Q5SVD6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r195Q5SVD6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r195Q5SVD6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r195Q5SVD6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r195Q5SVD6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r195Q5SVD6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r195Q5SVD6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r195Q5SVD6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r195Q5SVD6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r195Q5SVD6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r195Q5SVD6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r195Q5SVD6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r195Q5SVD6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r195Q5SVD6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r195Q5SVD6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r195Q5SVD6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r195Q5SVD6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r195Q5SVD6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r195Q5SVD6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r195Q5SVD6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r195Q5SVD6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r195Q5SVD6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r195Q5SVD6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r195Q5SVD6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r195Q5SVD6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vmn1r195Q5SVD6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vmn1r195Q5SVD6 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vmn1r195Q5SVD6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vmn1r195Q5SVD6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r195Q5SVD6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r195Q5SVD6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r195Q5SVD6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r195Q5SVD6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r195Q5SVD6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms