Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Fam71bQ5STT6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Fam71bQ5STT6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Fam71bQ5STT6 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fam71bQ5STT6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fam71bQ5STT6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fam71bQ5STT6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fam71bQ5STT6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fam71bQ5STT6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fam71bQ5STT6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fam71bQ5STT6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fam71bQ5STT6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fam71bQ5STT6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Fam71bQ5STT6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fam71bQ5STT6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fam71bQ5STT6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Fam71bQ5STT6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fam71bQ5STT6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fam71bQ5STT6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fam71bQ5STT6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fam71bQ5STT6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fam71bQ5STT6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fam71bQ5STT6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Fam71bQ5STT6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Fam71bQ5STT6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Fam71bQ5STT6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Fam71bQ5STT6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Fam71bQ5STT6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Fam71bQ5STT6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Fam71bQ5STT6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Fam71bQ5STT6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Fam71bQ5STT6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Fam71bQ5STT6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Fam71bQ5STT6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Fam71bQ5STT6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Fam71bQ5STT6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Fam71bQ5STT6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Fam71bQ5STT6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Fam71bQ5STT6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Fam71bQ5STT6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Fam71bQ5STT6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Fam71bQ5STT6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Fam71bQ5STT6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Fam71bQ5STT6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Fam71bQ5STT6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Fam71bQ5STT6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Fam71bQ5STT6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Fam71bQ5STT6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Fam71bQ5STT6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Fam71bQ5STT6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Fam71bQ5STT6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Fam71bQ5STT6 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Fam71bQ5STT6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Fam71bQ5STT6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Fam71bQ5STT6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Fam71bQ5STT6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Fam71bQ5STT6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Fam71bQ5STT6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Fam71bQ5STT6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Fam71bQ5STT6 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Fam71bQ5STT6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Fam71bQ5STT6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Fam71bQ5STT6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Fam71bQ5STT6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Fam71bQ5STT6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Fam71bQ5STT6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Fam71bQ5STT6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Fam71bQ5STT6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Fam71bQ5STT6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Fam71bQ5STT6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Fam71bQ5STT6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Fam71bQ5STT6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Fam71bQ5STT6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Fam71bQ5STT6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Fam71bQ5STT6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Fam71bQ5STT6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Fam71bQ5STT6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fam71bQ5STT6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fam71bQ5STT6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fam71bQ5STT6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fam71bQ5STT6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fam71bQ5STT6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Fam71bQ5STT6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fam71bQ5STT6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fam71bQ5STT6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fam71bQ5STT6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fam71bQ5STT6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fam71bQ5STT6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fam71bQ5STT6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fam71bQ5STT6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fam71bQ5STT6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fam71bQ5STT6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fam71bQ5STT6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fam71bQ5STT6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fam71bQ5STT6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fam71bQ5STT6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fam71bQ5STT6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fam71bQ5STT6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fam71bQ5STT6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fam71bQ5STT6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms