Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sft2d1Q5SSN7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sft2d1Q5SSN7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sft2d1Q5SSN7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sft2d1Q5SSN7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sft2d1Q5SSN7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sft2d1Q5SSN7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sft2d1Q5SSN7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sft2d1Q5SSN7 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sft2d1Q5SSN7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sft2d1Q5SSN7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sft2d1Q5SSN7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sft2d1Q5SSN7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sft2d1Q5SSN7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sft2d1Q5SSN7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sft2d1Q5SSN7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sft2d1Q5SSN7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sft2d1Q5SSN7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sft2d1Q5SSN7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sft2d1Q5SSN7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sft2d1Q5SSN7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sft2d1Q5SSN7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sft2d1Q5SSN7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sft2d1Q5SSN7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sft2d1Q5SSN7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sft2d1Q5SSN7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sft2d1Q5SSN7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sft2d1Q5SSN7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sft2d1Q5SSN7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sft2d1Q5SSN7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sft2d1Q5SSN7 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sft2d1Q5SSN7 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sft2d1Q5SSN7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sft2d1Q5SSN7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sft2d1Q5SSN7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sft2d1Q5SSN7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sft2d1Q5SSN7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sft2d1Q5SSN7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sft2d1Q5SSN7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sft2d1Q5SSN7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sft2d1Q5SSN7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sft2d1Q5SSN7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sft2d1Q5SSN7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sft2d1Q5SSN7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sft2d1Q5SSN7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sft2d1Q5SSN7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sft2d1Q5SSN7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sft2d1Q5SSN7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sft2d1Q5SSN7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sft2d1Q5SSN7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sft2d1Q5SSN7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sft2d1Q5SSN7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sft2d1Q5SSN7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sft2d1Q5SSN7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sft2d1Q5SSN7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sft2d1Q5SSN7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sft2d1Q5SSN7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sft2d1Q5SSN7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sft2d1Q5SSN7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sft2d1Q5SSN7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sft2d1Q5SSN7 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sft2d1Q5SSN7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sft2d1Q5SSN7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sft2d1Q5SSN7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sft2d1Q5SSN7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sft2d1Q5SSN7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sft2d1Q5SSN7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sft2d1Q5SSN7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sft2d1Q5SSN7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sft2d1Q5SSN7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sft2d1Q5SSN7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Sft2d1Q5SSN7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Sft2d1Q5SSN7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sft2d1Q5SSN7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sft2d1Q5SSN7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sft2d1Q5SSN7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sft2d1Q5SSN7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sft2d1Q5SSN7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sft2d1Q5SSN7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sft2d1Q5SSN7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sft2d1Q5SSN7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sft2d1Q5SSN7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sft2d1Q5SSN7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sft2d1Q5SSN7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sft2d1Q5SSN7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sft2d1Q5SSN7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sft2d1Q5SSN7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sft2d1Q5SSN7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sft2d1Q5SSN7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sft2d1Q5SSN7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sft2d1Q5SSN7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms