Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Phf12Q5SPL2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Phf12Q5SPL2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Phf12Q5SPL2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Phf12Q5SPL2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Phf12Q5SPL2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Phf12Q5SPL2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Phf12Q5SPL2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Phf12Q5SPL2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Phf12Q5SPL2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Phf12Q5SPL2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Phf12Q5SPL2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Phf12Q5SPL2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Phf12Q5SPL2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Phf12Q5SPL2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Phf12Q5SPL2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Phf12Q5SPL2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Phf12Q5SPL2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Phf12Q5SPL2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Phf12Q5SPL2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Phf12Q5SPL2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Phf12Q5SPL2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Phf12Q5SPL2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Phf12Q5SPL2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Phf12Q5SPL2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Phf12Q5SPL2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Phf12Q5SPL2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Phf12Q5SPL2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Phf12Q5SPL2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Phf12Q5SPL2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Phf12Q5SPL2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Phf12Q5SPL2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Phf12Q5SPL2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Phf12Q5SPL2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Phf12Q5SPL2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Phf12Q5SPL2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Phf12Q5SPL2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Phf12Q5SPL2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Phf12Q5SPL2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Phf12Q5SPL2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Phf12Q5SPL2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Phf12Q5SPL2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Phf12Q5SPL2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Phf12Q5SPL2 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Phf12Q5SPL2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Phf12Q5SPL2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Phf12Q5SPL2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Phf12Q5SPL2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Phf12Q5SPL2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Phf12Q5SPL2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Phf12Q5SPL2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Phf12Q5SPL2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Phf12Q5SPL2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Phf12Q5SPL2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Phf12Q5SPL2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Phf12Q5SPL2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Phf12Q5SPL2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Phf12Q5SPL2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Phf12Q5SPL2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Phf12Q5SPL2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Phf12Q5SPL2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Phf12Q5SPL2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Phf12Q5SPL2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Phf12Q5SPL2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Phf12Q5SPL2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Phf12Q5SPL2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Phf12Q5SPL2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Phf12Q5SPL2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Phf12Q5SPL2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Phf12Q5SPL2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Phf12Q5SPL2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Phf12Q5SPL2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Phf12Q5SPL2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Phf12Q5SPL2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Phf12Q5SPL2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Phf12Q5SPL2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Phf12Q5SPL2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Phf12Q5SPL2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Phf12Q5SPL2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Phf12Q5SPL2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Phf12Q5SPL2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Phf12Q5SPL2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Phf12Q5SPL2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Phf12Q5SPL2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Phf12Q5SPL2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Phf12Q5SPL2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Phf12Q5SPL2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Phf12Q5SPL2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Phf12Q5SPL2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Phf12Q5SPL2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Phf12Q5SPL2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Phf12Q5SPL2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Phf12Q5SPL2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Phf12Q5SPL2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Phf12Q5SPL2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Phf12Q5SPL2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Phf12Q5SPL2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Phf12Q5SPL2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Phf12Q5SPL2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Phf12Q5SPL2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms