Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC97

Vmn1r209, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r209Q5NC97 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vmn1r209Q5NC97 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vmn1r209Q5NC97 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vmn1r209Q5NC97 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vmn1r209Q5NC97 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vmn1r209Q5NC97 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn1r209Q5NC97 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn1r209Q5NC97 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn1r209Q5NC97 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn1r209Q5NC97 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn1r209Q5NC97 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn1r209Q5NC97 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn1r209Q5NC97 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn1r209Q5NC97 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn1r209Q5NC97 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn1r209Q5NC97 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn1r209Q5NC97 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn1r209Q5NC97 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn1r209Q5NC97 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn1r209Q5NC97 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn1r209Q5NC97 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn1r209Q5NC97 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn1r209Q5NC97 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn1r209Q5NC97 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn1r209Q5NC97 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn1r209Q5NC97 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn1r209Q5NC97 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn1r209Q5NC97 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn1r209Q5NC97 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn1r209Q5NC97 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn1r209Q5NC97 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmn1r209Q5NC97 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmn1r209Q5NC97 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmn1r209Q5NC97 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmn1r209Q5NC97 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmn1r209Q5NC97 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmn1r209Q5NC97 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmn1r209Q5NC97 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmn1r209Q5NC97 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn1r209Q5NC97 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn1r209Q5NC97 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn1r209Q5NC97 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn1r209Q5NC97 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn1r209Q5NC97 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn1r209Q5NC97 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn1r209Q5NC97 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn1r209Q5NC97 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn1r209Q5NC97 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn1r209Q5NC97 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn1r209Q5NC97 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn1r209Q5NC97 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn1r209Q5NC97 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn1r209Q5NC97 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn1r209Q5NC97 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn1r209Q5NC97 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn1r209Q5NC97 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn1r209Q5NC97 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn1r209Q5NC97 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn1r209Q5NC97 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn1r209Q5NC97 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn1r209Q5NC97 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn1r209Q5NC97 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn1r209Q5NC97 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn1r209Q5NC97 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn1r209Q5NC97 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn1r209Q5NC97 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn1r209Q5NC97 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn1r209Q5NC97 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn1r209Q5NC97 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn1r209Q5NC97 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn1r209Q5NC97 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn1r209Q5NC97 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn1r209Q5NC97 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn1r209Q5NC97 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn1r209Q5NC97 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn1r209Q5NC97 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn1r209Q5NC97 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn1r209Q5NC97 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn1r209Q5NC97 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn1r209Q5NC97 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn1r209Q5NC97 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn1r209Q5NC97 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn1r209Q5NC97 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn1r209Q5NC97 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn1r209Q5NC97 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn1r209Q5NC97 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vmn1r209Q5NC97 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vmn1r209Q5NC97 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vmn1r209Q5NC97 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vmn1r209Q5NC97 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vmn1r209Q5NC97 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vmn1r209Q5NC97 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Vmn1r209Q5NC97 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vmn1r209Q5NC97 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vmn1r209Q5NC97 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vmn1r209Q5NC97 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vmn1r209Q5NC97 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vmn1r209Q5NC97 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vmn1r209Q5NC97 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vmn1r209Q5NC97 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms