Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC41

1810065E05Rik, RIKEN cDNA 1810065E05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810065E05RikQ5NC41 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
1810065E05RikQ5NC41 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
1810065E05RikQ5NC41 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
1810065E05RikQ5NC41 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
1810065E05RikQ5NC41 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
1810065E05RikQ5NC41 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
1810065E05RikQ5NC41 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
1810065E05RikQ5NC41 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
1810065E05RikQ5NC41 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
1810065E05RikQ5NC41 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
1810065E05RikQ5NC41 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
1810065E05RikQ5NC41 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
1810065E05RikQ5NC41 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
1810065E05RikQ5NC41 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
1810065E05RikQ5NC41 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
1810065E05RikQ5NC41 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
1810065E05RikQ5NC41 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
1810065E05RikQ5NC41 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
1810065E05RikQ5NC41 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
1810065E05RikQ5NC41 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
1810065E05RikQ5NC41 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
1810065E05RikQ5NC41 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
1810065E05RikQ5NC41 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
1810065E05RikQ5NC41 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
1810065E05RikQ5NC41 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
1810065E05RikQ5NC41 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
1810065E05RikQ5NC41 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
1810065E05RikQ5NC41 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
1810065E05RikQ5NC41 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
1810065E05RikQ5NC41 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
1810065E05RikQ5NC41 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
1810065E05RikQ5NC41 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
1810065E05RikQ5NC41 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
1810065E05RikQ5NC41 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
1810065E05RikQ5NC41 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
1810065E05RikQ5NC41 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
1810065E05RikQ5NC41 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
1810065E05RikQ5NC41 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
1810065E05RikQ5NC41 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
1810065E05RikQ5NC41 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
1810065E05RikQ5NC41 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
1810065E05RikQ5NC41 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
1810065E05RikQ5NC41 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
1810065E05RikQ5NC41 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
1810065E05RikQ5NC41 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
1810065E05RikQ5NC41 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
1810065E05RikQ5NC41 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
1810065E05RikQ5NC41 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
1810065E05RikQ5NC41 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
1810065E05RikQ5NC41 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
1810065E05RikQ5NC41 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
1810065E05RikQ5NC41 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
1810065E05RikQ5NC41 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
1810065E05RikQ5NC41 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
1810065E05RikQ5NC41 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
1810065E05RikQ5NC41 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
1810065E05RikQ5NC41 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
1810065E05RikQ5NC41 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
1810065E05RikQ5NC41 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
1810065E05RikQ5NC41 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
1810065E05RikQ5NC41 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
1810065E05RikQ5NC41 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
1810065E05RikQ5NC41 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
1810065E05RikQ5NC41 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
1810065E05RikQ5NC41 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
1810065E05RikQ5NC41 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
1810065E05RikQ5NC41 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
1810065E05RikQ5NC41 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
1810065E05RikQ5NC41 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
1810065E05RikQ5NC41 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
1810065E05RikQ5NC41 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
1810065E05RikQ5NC41 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
1810065E05RikQ5NC41 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
1810065E05RikQ5NC41 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
1810065E05RikQ5NC41 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
1810065E05RikQ5NC41 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
1810065E05RikQ5NC41 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
1810065E05RikQ5NC41 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
1810065E05RikQ5NC41 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
1810065E05RikQ5NC41 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
1810065E05RikQ5NC41 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
1810065E05RikQ5NC41 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
1810065E05RikQ5NC41 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
1810065E05RikQ5NC41 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
1810065E05RikQ5NC41 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
1810065E05RikQ5NC41 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
1810065E05RikQ5NC41 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
1810065E05RikQ5NC41 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
1810065E05RikQ5NC41 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
1810065E05RikQ5NC41 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
1810065E05RikQ5NC41 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
1810065E05RikQ5NC41 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
1810065E05RikQ5NC41 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
1810065E05RikQ5NC41 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
1810065E05RikQ5NC41 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
1810065E05RikQ5NC41 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
1810065E05RikQ5NC41 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
1810065E05RikQ5NC41 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
1810065E05RikQ5NC41 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
1810065E05RikQ5NC41 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms