Protein–RNA interactions for Protein: Q5NBX1

Cobl, Protein cordon-bleu, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CoblQ5NBX1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CoblQ5NBX1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CoblQ5NBX1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CoblQ5NBX1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CoblQ5NBX1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CoblQ5NBX1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CoblQ5NBX1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CoblQ5NBX1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CoblQ5NBX1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CoblQ5NBX1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CoblQ5NBX1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CoblQ5NBX1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CoblQ5NBX1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CoblQ5NBX1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CoblQ5NBX1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CoblQ5NBX1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CoblQ5NBX1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CoblQ5NBX1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CoblQ5NBX1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CoblQ5NBX1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CoblQ5NBX1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CoblQ5NBX1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CoblQ5NBX1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CoblQ5NBX1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CoblQ5NBX1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CoblQ5NBX1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CoblQ5NBX1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CoblQ5NBX1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CoblQ5NBX1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CoblQ5NBX1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CoblQ5NBX1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CoblQ5NBX1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CoblQ5NBX1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CoblQ5NBX1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CoblQ5NBX1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CoblQ5NBX1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CoblQ5NBX1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CoblQ5NBX1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CoblQ5NBX1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CoblQ5NBX1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CoblQ5NBX1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CoblQ5NBX1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CoblQ5NBX1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CoblQ5NBX1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CoblQ5NBX1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CoblQ5NBX1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CoblQ5NBX1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CoblQ5NBX1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CoblQ5NBX1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CoblQ5NBX1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CoblQ5NBX1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CoblQ5NBX1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CoblQ5NBX1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CoblQ5NBX1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CoblQ5NBX1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CoblQ5NBX1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CoblQ5NBX1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CoblQ5NBX1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CoblQ5NBX1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CoblQ5NBX1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CoblQ5NBX1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CoblQ5NBX1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CoblQ5NBX1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CoblQ5NBX1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CoblQ5NBX1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CoblQ5NBX1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
CoblQ5NBX1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CoblQ5NBX1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
CoblQ5NBX1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CoblQ5NBX1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CoblQ5NBX1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CoblQ5NBX1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CoblQ5NBX1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CoblQ5NBX1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CoblQ5NBX1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CoblQ5NBX1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CoblQ5NBX1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CoblQ5NBX1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CoblQ5NBX1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CoblQ5NBX1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CoblQ5NBX1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CoblQ5NBX1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CoblQ5NBX1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CoblQ5NBX1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CoblQ5NBX1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CoblQ5NBX1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CoblQ5NBX1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CoblQ5NBX1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CoblQ5NBX1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CoblQ5NBX1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CoblQ5NBX1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CoblQ5NBX1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CoblQ5NBX1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CoblQ5NBX1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CoblQ5NBX1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CoblQ5NBX1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CoblQ5NBX1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CoblQ5NBX1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CoblQ5NBX1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CoblQ5NBX1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms