Protein–RNA interactions for Protein: Q5I043

Usp28, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 28, mousemouse

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Length 1,051 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp28Q5I043 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp28Q5I043 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp28Q5I043 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp28Q5I043 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Usp28Q5I043 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp28Q5I043 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp28Q5I043 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp28Q5I043 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp28Q5I043 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp28Q5I043 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp28Q5I043 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp28Q5I043 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp28Q5I043 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp28Q5I043 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp28Q5I043 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp28Q5I043 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp28Q5I043 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp28Q5I043 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp28Q5I043 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp28Q5I043 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp28Q5I043 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp28Q5I043 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp28Q5I043 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp28Q5I043 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp28Q5I043 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp28Q5I043 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp28Q5I043 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp28Q5I043 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp28Q5I043 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp28Q5I043 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp28Q5I043 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp28Q5I043 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp28Q5I043 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp28Q5I043 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp28Q5I043 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp28Q5I043 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp28Q5I043 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp28Q5I043 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp28Q5I043 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp28Q5I043 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp28Q5I043 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp28Q5I043 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp28Q5I043 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp28Q5I043 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp28Q5I043 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp28Q5I043 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp28Q5I043 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp28Q5I043 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp28Q5I043 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Usp28Q5I043 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Usp28Q5I043 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Usp28Q5I043 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Usp28Q5I043 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp28Q5I043 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp28Q5I043 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp28Q5I043 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp28Q5I043 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp28Q5I043 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp28Q5I043 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp28Q5I043 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp28Q5I043 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp28Q5I043 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp28Q5I043 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp28Q5I043 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp28Q5I043 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp28Q5I043 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp28Q5I043 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp28Q5I043 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp28Q5I043 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp28Q5I043 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp28Q5I043 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp28Q5I043 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp28Q5I043 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp28Q5I043 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp28Q5I043 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp28Q5I043 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp28Q5I043 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp28Q5I043 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp28Q5I043 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp28Q5I043 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp28Q5I043 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp28Q5I043 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp28Q5I043 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp28Q5I043 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp28Q5I043 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp28Q5I043 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp28Q5I043 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp28Q5I043 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp28Q5I043 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp28Q5I043 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp28Q5I043 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp28Q5I043 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp28Q5I043 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp28Q5I043 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp28Q5I043 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp28Q5I043 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp28Q5I043 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp28Q5I043 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Usp28Q5I043 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp28Q5I043 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
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