Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Taf3Q5HZG4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Taf3Q5HZG4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Taf3Q5HZG4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Taf3Q5HZG4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Taf3Q5HZG4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Taf3Q5HZG4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Taf3Q5HZG4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Taf3Q5HZG4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Taf3Q5HZG4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Taf3Q5HZG4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Taf3Q5HZG4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Taf3Q5HZG4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Taf3Q5HZG4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Taf3Q5HZG4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Taf3Q5HZG4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Taf3Q5HZG4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Taf3Q5HZG4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Taf3Q5HZG4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Taf3Q5HZG4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Taf3Q5HZG4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Taf3Q5HZG4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Taf3Q5HZG4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Taf3Q5HZG4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Taf3Q5HZG4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Taf3Q5HZG4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Taf3Q5HZG4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Taf3Q5HZG4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Taf3Q5HZG4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Taf3Q5HZG4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Taf3Q5HZG4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Taf3Q5HZG4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Taf3Q5HZG4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Taf3Q5HZG4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Taf3Q5HZG4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Taf3Q5HZG4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Taf3Q5HZG4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Taf3Q5HZG4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Taf3Q5HZG4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Taf3Q5HZG4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Taf3Q5HZG4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Taf3Q5HZG4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Taf3Q5HZG4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Taf3Q5HZG4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Taf3Q5HZG4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Taf3Q5HZG4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Taf3Q5HZG4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Taf3Q5HZG4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Taf3Q5HZG4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Taf3Q5HZG4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Taf3Q5HZG4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Taf3Q5HZG4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Taf3Q5HZG4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Taf3Q5HZG4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Taf3Q5HZG4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Taf3Q5HZG4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Taf3Q5HZG4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Taf3Q5HZG4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Taf3Q5HZG4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Taf3Q5HZG4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Taf3Q5HZG4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Taf3Q5HZG4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Taf3Q5HZG4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Taf3Q5HZG4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Taf3Q5HZG4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Taf3Q5HZG4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Taf3Q5HZG4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Taf3Q5HZG4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Taf3Q5HZG4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Taf3Q5HZG4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Taf3Q5HZG4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Taf3Q5HZG4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Taf3Q5HZG4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Taf3Q5HZG4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Taf3Q5HZG4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Taf3Q5HZG4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Taf3Q5HZG4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Taf3Q5HZG4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Taf3Q5HZG4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Taf3Q5HZG4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Taf3Q5HZG4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Taf3Q5HZG4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Taf3Q5HZG4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Taf3Q5HZG4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Taf3Q5HZG4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Taf3Q5HZG4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Taf3Q5HZG4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Taf3Q5HZG4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Taf3Q5HZG4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Taf3Q5HZG4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Taf3Q5HZG4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Taf3Q5HZG4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Taf3Q5HZG4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Taf3Q5HZG4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Taf3Q5HZG4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Taf3Q5HZG4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Taf3Q5HZG4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Taf3Q5HZG4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Taf3Q5HZG4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Taf3Q5HZG4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms