Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nlrc3Q5DU56 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Nlrc3Q5DU56 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nlrc3Q5DU56 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nlrc3Q5DU56 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nlrc3Q5DU56 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nlrc3Q5DU56 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nlrc3Q5DU56 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nlrc3Q5DU56 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nlrc3Q5DU56 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Nlrc3Q5DU56 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nlrc3Q5DU56 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Nlrc3Q5DU56 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nlrc3Q5DU56 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nlrc3Q5DU56 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Nlrc3Q5DU56 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nlrc3Q5DU56 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nlrc3Q5DU56 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nlrc3Q5DU56 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nlrc3Q5DU56 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nlrc3Q5DU56 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nlrc3Q5DU56 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nlrc3Q5DU56 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nlrc3Q5DU56 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nlrc3Q5DU56 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nlrc3Q5DU56 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nlrc3Q5DU56 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nlrc3Q5DU56 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nlrc3Q5DU56 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nlrc3Q5DU56 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nlrc3Q5DU56 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nlrc3Q5DU56 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nlrc3Q5DU56 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nlrc3Q5DU56 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nlrc3Q5DU56 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nlrc3Q5DU56 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nlrc3Q5DU56 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nlrc3Q5DU56 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nlrc3Q5DU56 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nlrc3Q5DU56 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nlrc3Q5DU56 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nlrc3Q5DU56 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nlrc3Q5DU56 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nlrc3Q5DU56 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nlrc3Q5DU56 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nlrc3Q5DU56 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nlrc3Q5DU56 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nlrc3Q5DU56 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nlrc3Q5DU56 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nlrc3Q5DU56 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nlrc3Q5DU56 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nlrc3Q5DU56 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nlrc3Q5DU56 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nlrc3Q5DU56 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nlrc3Q5DU56 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nlrc3Q5DU56 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nlrc3Q5DU56 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nlrc3Q5DU56 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nlrc3Q5DU56 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nlrc3Q5DU56 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nlrc3Q5DU56 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nlrc3Q5DU56 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nlrc3Q5DU56 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nlrc3Q5DU56 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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Nlrc3Q5DU56 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
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Nlrc3Q5DU56 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nlrc3Q5DU56 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nlrc3Q5DU56 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nlrc3Q5DU56 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nlrc3Q5DU56 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nlrc3Q5DU56 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nlrc3Q5DU56 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nlrc3Q5DU56 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nlrc3Q5DU56 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nlrc3Q5DU56 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nlrc3Q5DU56 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nlrc3Q5DU56 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nlrc3Q5DU56 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nlrc3Q5DU56 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nlrc3Q5DU56 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nlrc3Q5DU56 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nlrc3Q5DU56 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nlrc3Q5DU56 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nlrc3Q5DU56 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nlrc3Q5DU56 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nlrc3Q5DU56 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nlrc3Q5DU56 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nlrc3Q5DU56 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nlrc3Q5DU56 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nlrc3Q5DU56 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nlrc3Q5DU56 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nlrc3Q5DU56 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nlrc3Q5DU56 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nlrc3Q5DU56 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms