Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKP2

Usp13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp13Q5BKP2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp13Q5BKP2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp13Q5BKP2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp13Q5BKP2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp13Q5BKP2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp13Q5BKP2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp13Q5BKP2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp13Q5BKP2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp13Q5BKP2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp13Q5BKP2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp13Q5BKP2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp13Q5BKP2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp13Q5BKP2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp13Q5BKP2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp13Q5BKP2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp13Q5BKP2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp13Q5BKP2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp13Q5BKP2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp13Q5BKP2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp13Q5BKP2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp13Q5BKP2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp13Q5BKP2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp13Q5BKP2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp13Q5BKP2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp13Q5BKP2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp13Q5BKP2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp13Q5BKP2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp13Q5BKP2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp13Q5BKP2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Usp13Q5BKP2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp13Q5BKP2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp13Q5BKP2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp13Q5BKP2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp13Q5BKP2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp13Q5BKP2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp13Q5BKP2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp13Q5BKP2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp13Q5BKP2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp13Q5BKP2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp13Q5BKP2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp13Q5BKP2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp13Q5BKP2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp13Q5BKP2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp13Q5BKP2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp13Q5BKP2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp13Q5BKP2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp13Q5BKP2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp13Q5BKP2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp13Q5BKP2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp13Q5BKP2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp13Q5BKP2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp13Q5BKP2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp13Q5BKP2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp13Q5BKP2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp13Q5BKP2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp13Q5BKP2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp13Q5BKP2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp13Q5BKP2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp13Q5BKP2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp13Q5BKP2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp13Q5BKP2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp13Q5BKP2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp13Q5BKP2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp13Q5BKP2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp13Q5BKP2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp13Q5BKP2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp13Q5BKP2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp13Q5BKP2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp13Q5BKP2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp13Q5BKP2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp13Q5BKP2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp13Q5BKP2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp13Q5BKP2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp13Q5BKP2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp13Q5BKP2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp13Q5BKP2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp13Q5BKP2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp13Q5BKP2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp13Q5BKP2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp13Q5BKP2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp13Q5BKP2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp13Q5BKP2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp13Q5BKP2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp13Q5BKP2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp13Q5BKP2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp13Q5BKP2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp13Q5BKP2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp13Q5BKP2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp13Q5BKP2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp13Q5BKP2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp13Q5BKP2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp13Q5BKP2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp13Q5BKP2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp13Q5BKP2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp13Q5BKP2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp13Q5BKP2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp13Q5BKP2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp13Q5BKP2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Usp13Q5BKP2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Usp13Q5BKP2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms