Protein–RNA interactions for Protein: Q56A04

Eme2, Probable crossover junction endonuclease EME2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eme2Q56A04 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Eme2Q56A04 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Eme2Q56A04 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Eme2Q56A04 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Eme2Q56A04 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Eme2Q56A04 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Eme2Q56A04 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Eme2Q56A04 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Eme2Q56A04 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Eme2Q56A04 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Eme2Q56A04 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Eme2Q56A04 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Eme2Q56A04 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Eme2Q56A04 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Eme2Q56A04 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Eme2Q56A04 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Eme2Q56A04 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Eme2Q56A04 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Eme2Q56A04 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Eme2Q56A04 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Eme2Q56A04 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Eme2Q56A04 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Eme2Q56A04 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Eme2Q56A04 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Eme2Q56A04 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Eme2Q56A04 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Eme2Q56A04 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Eme2Q56A04 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Eme2Q56A04 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Eme2Q56A04 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Eme2Q56A04 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Eme2Q56A04 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Eme2Q56A04 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Eme2Q56A04 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Eme2Q56A04 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Eme2Q56A04 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Eme2Q56A04 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Eme2Q56A04 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Eme2Q56A04 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Eme2Q56A04 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Eme2Q56A04 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Eme2Q56A04 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Eme2Q56A04 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Eme2Q56A04 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Eme2Q56A04 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Eme2Q56A04 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Eme2Q56A04 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Eme2Q56A04 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Eme2Q56A04 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Eme2Q56A04 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Eme2Q56A04 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Eme2Q56A04 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Eme2Q56A04 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Eme2Q56A04 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Eme2Q56A04 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Eme2Q56A04 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Eme2Q56A04 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Eme2Q56A04 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Eme2Q56A04 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Eme2Q56A04 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Eme2Q56A04 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Eme2Q56A04 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Eme2Q56A04 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Eme2Q56A04 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Eme2Q56A04 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Eme2Q56A04 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Eme2Q56A04 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Eme2Q56A04 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Eme2Q56A04 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Eme2Q56A04 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Eme2Q56A04 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Eme2Q56A04 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Eme2Q56A04 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Eme2Q56A04 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Eme2Q56A04 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Eme2Q56A04 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Eme2Q56A04 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Eme2Q56A04 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Eme2Q56A04 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Eme2Q56A04 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Eme2Q56A04 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Eme2Q56A04 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Eme2Q56A04 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Eme2Q56A04 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Eme2Q56A04 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Eme2Q56A04 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Eme2Q56A04 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Eme2Q56A04 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Eme2Q56A04 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Eme2Q56A04 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Eme2Q56A04 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Eme2Q56A04 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Eme2Q56A04 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Eme2Q56A04 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Eme2Q56A04 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Eme2Q56A04 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Eme2Q56A04 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Eme2Q56A04 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Eme2Q56A04 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Eme2Q56A04 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms