Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrig2Q52KR2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrig2Q52KR2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrig2Q52KR2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrig2Q52KR2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrig2Q52KR2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrig2Q52KR2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrig2Q52KR2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrig2Q52KR2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrig2Q52KR2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrig2Q52KR2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrig2Q52KR2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrig2Q52KR2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrig2Q52KR2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrig2Q52KR2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrig2Q52KR2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrig2Q52KR2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrig2Q52KR2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrig2Q52KR2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrig2Q52KR2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrig2Q52KR2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrig2Q52KR2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrig2Q52KR2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrig2Q52KR2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrig2Q52KR2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrig2Q52KR2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrig2Q52KR2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrig2Q52KR2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrig2Q52KR2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrig2Q52KR2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrig2Q52KR2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrig2Q52KR2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrig2Q52KR2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrig2Q52KR2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrig2Q52KR2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrig2Q52KR2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrig2Q52KR2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrig2Q52KR2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrig2Q52KR2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrig2Q52KR2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrig2Q52KR2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrig2Q52KR2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrig2Q52KR2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrig2Q52KR2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrig2Q52KR2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrig2Q52KR2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrig2Q52KR2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrig2Q52KR2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrig2Q52KR2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrig2Q52KR2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrig2Q52KR2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrig2Q52KR2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrig2Q52KR2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrig2Q52KR2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrig2Q52KR2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrig2Q52KR2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrig2Q52KR2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrig2Q52KR2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrig2Q52KR2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrig2Q52KR2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Lrig2Q52KR2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrig2Q52KR2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrig2Q52KR2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrig2Q52KR2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrig2Q52KR2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrig2Q52KR2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrig2Q52KR2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrig2Q52KR2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrig2Q52KR2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrig2Q52KR2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrig2Q52KR2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrig2Q52KR2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrig2Q52KR2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrig2Q52KR2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrig2Q52KR2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrig2Q52KR2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrig2Q52KR2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrig2Q52KR2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrig2Q52KR2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrig2Q52KR2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrig2Q52KR2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrig2Q52KR2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrig2Q52KR2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrig2Q52KR2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrig2Q52KR2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrig2Q52KR2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrig2Q52KR2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrig2Q52KR2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrig2Q52KR2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrig2Q52KR2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrig2Q52KR2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrig2Q52KR2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrig2Q52KR2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrig2Q52KR2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrig2Q52KR2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrig2Q52KR2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrig2Q52KR2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrig2Q52KR2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrig2Q52KR2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrig2Q52KR2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms