Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Spire1Q52KF3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Spire1Q52KF3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Spire1Q52KF3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Spire1Q52KF3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Spire1Q52KF3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Spire1Q52KF3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Spire1Q52KF3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Spire1Q52KF3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Spire1Q52KF3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Spire1Q52KF3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Spire1Q52KF3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Spire1Q52KF3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Spire1Q52KF3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Spire1Q52KF3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Spire1Q52KF3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Spire1Q52KF3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Spire1Q52KF3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Spire1Q52KF3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Spire1Q52KF3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spire1Q52KF3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spire1Q52KF3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spire1Q52KF3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spire1Q52KF3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spire1Q52KF3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spire1Q52KF3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spire1Q52KF3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Spire1Q52KF3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spire1Q52KF3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spire1Q52KF3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spire1Q52KF3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spire1Q52KF3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Spire1Q52KF3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spire1Q52KF3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spire1Q52KF3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spire1Q52KF3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spire1Q52KF3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spire1Q52KF3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spire1Q52KF3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Spire1Q52KF3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Spire1Q52KF3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Spire1Q52KF3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Spire1Q52KF3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Spire1Q52KF3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Spire1Q52KF3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Spire1Q52KF3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Spire1Q52KF3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Spire1Q52KF3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Spire1Q52KF3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Spire1Q52KF3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Spire1Q52KF3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Spire1Q52KF3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Spire1Q52KF3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Spire1Q52KF3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Spire1Q52KF3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Spire1Q52KF3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Spire1Q52KF3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Spire1Q52KF3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Spire1Q52KF3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Spire1Q52KF3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Spire1Q52KF3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Spire1Q52KF3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Spire1Q52KF3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Spire1Q52KF3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Spire1Q52KF3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Spire1Q52KF3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Spire1Q52KF3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Spire1Q52KF3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spire1Q52KF3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spire1Q52KF3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spire1Q52KF3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spire1Q52KF3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spire1Q52KF3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spire1Q52KF3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spire1Q52KF3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spire1Q52KF3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spire1Q52KF3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spire1Q52KF3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spire1Q52KF3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Spire1Q52KF3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Spire1Q52KF3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spire1Q52KF3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spire1Q52KF3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spire1Q52KF3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Spire1Q52KF3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Spire1Q52KF3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Spire1Q52KF3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Spire1Q52KF3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Spire1Q52KF3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Spire1Q52KF3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Spire1Q52KF3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Spire1Q52KF3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Spire1Q52KF3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Spire1Q52KF3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Spire1Q52KF3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Spire1Q52KF3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Spire1Q52KF3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Spire1Q52KF3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Spire1Q52KF3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Spire1Q52KF3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms