Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJN1

C1qtnf9, Complement C1q and tumor necrosis factor-related protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1qtnf9Q4ZJN1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C1qtnf9Q4ZJN1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C1qtnf9Q4ZJN1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C1qtnf9Q4ZJN1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C1qtnf9Q4ZJN1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C1qtnf9Q4ZJN1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C1qtnf9Q4ZJN1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C1qtnf9Q4ZJN1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C1qtnf9Q4ZJN1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C1qtnf9Q4ZJN1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C1qtnf9Q4ZJN1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C1qtnf9Q4ZJN1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C1qtnf9Q4ZJN1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C1qtnf9Q4ZJN1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C1qtnf9Q4ZJN1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C1qtnf9Q4ZJN1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C1qtnf9Q4ZJN1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C1qtnf9Q4ZJN1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
C1qtnf9Q4ZJN1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C1qtnf9Q4ZJN1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C1qtnf9Q4ZJN1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C1qtnf9Q4ZJN1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C1qtnf9Q4ZJN1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C1qtnf9Q4ZJN1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C1qtnf9Q4ZJN1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C1qtnf9Q4ZJN1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C1qtnf9Q4ZJN1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C1qtnf9Q4ZJN1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
C1qtnf9Q4ZJN1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C1qtnf9Q4ZJN1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C1qtnf9Q4ZJN1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C1qtnf9Q4ZJN1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C1qtnf9Q4ZJN1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C1qtnf9Q4ZJN1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C1qtnf9Q4ZJN1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C1qtnf9Q4ZJN1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
C1qtnf9Q4ZJN1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C1qtnf9Q4ZJN1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C1qtnf9Q4ZJN1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C1qtnf9Q4ZJN1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C1qtnf9Q4ZJN1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C1qtnf9Q4ZJN1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
C1qtnf9Q4ZJN1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C1qtnf9Q4ZJN1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C1qtnf9Q4ZJN1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C1qtnf9Q4ZJN1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C1qtnf9Q4ZJN1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C1qtnf9Q4ZJN1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C1qtnf9Q4ZJN1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C1qtnf9Q4ZJN1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C1qtnf9Q4ZJN1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C1qtnf9Q4ZJN1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C1qtnf9Q4ZJN1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C1qtnf9Q4ZJN1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
C1qtnf9Q4ZJN1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C1qtnf9Q4ZJN1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C1qtnf9Q4ZJN1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C1qtnf9Q4ZJN1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C1qtnf9Q4ZJN1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1qtnf9Q4ZJN1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1qtnf9Q4ZJN1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1qtnf9Q4ZJN1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1qtnf9Q4ZJN1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1qtnf9Q4ZJN1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1qtnf9Q4ZJN1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C1qtnf9Q4ZJN1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C1qtnf9Q4ZJN1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C1qtnf9Q4ZJN1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
C1qtnf9Q4ZJN1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
C1qtnf9Q4ZJN1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
C1qtnf9Q4ZJN1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
C1qtnf9Q4ZJN1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
C1qtnf9Q4ZJN1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C1qtnf9Q4ZJN1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C1qtnf9Q4ZJN1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C1qtnf9Q4ZJN1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C1qtnf9Q4ZJN1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
C1qtnf9Q4ZJN1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
C1qtnf9Q4ZJN1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
C1qtnf9Q4ZJN1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
C1qtnf9Q4ZJN1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
C1qtnf9Q4ZJN1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C1qtnf9Q4ZJN1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C1qtnf9Q4ZJN1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C1qtnf9Q4ZJN1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C1qtnf9Q4ZJN1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms