Protein–RNA interactions for Protein: Q4V9W2

Srek1ip1, Protein SREK1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srek1ip1Q4V9W2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Srek1ip1Q4V9W2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Srek1ip1Q4V9W2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Srek1ip1Q4V9W2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Srek1ip1Q4V9W2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Srek1ip1Q4V9W2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Srek1ip1Q4V9W2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Srek1ip1Q4V9W2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Srek1ip1Q4V9W2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Srek1ip1Q4V9W2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Srek1ip1Q4V9W2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Srek1ip1Q4V9W2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Srek1ip1Q4V9W2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Srek1ip1Q4V9W2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Srek1ip1Q4V9W2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Srek1ip1Q4V9W2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Srek1ip1Q4V9W2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Srek1ip1Q4V9W2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Srek1ip1Q4V9W2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Srek1ip1Q4V9W2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Srek1ip1Q4V9W2 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Srek1ip1Q4V9W2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Srek1ip1Q4V9W2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Srek1ip1Q4V9W2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Srek1ip1Q4V9W2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Srek1ip1Q4V9W2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Srek1ip1Q4V9W2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Srek1ip1Q4V9W2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Srek1ip1Q4V9W2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Srek1ip1Q4V9W2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Srek1ip1Q4V9W2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srek1ip1Q4V9W2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srek1ip1Q4V9W2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srek1ip1Q4V9W2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srek1ip1Q4V9W2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srek1ip1Q4V9W2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srek1ip1Q4V9W2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srek1ip1Q4V9W2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srek1ip1Q4V9W2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srek1ip1Q4V9W2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srek1ip1Q4V9W2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srek1ip1Q4V9W2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srek1ip1Q4V9W2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srek1ip1Q4V9W2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srek1ip1Q4V9W2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srek1ip1Q4V9W2 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Srek1ip1Q4V9W2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srek1ip1Q4V9W2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srek1ip1Q4V9W2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srek1ip1Q4V9W2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srek1ip1Q4V9W2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srek1ip1Q4V9W2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srek1ip1Q4V9W2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srek1ip1Q4V9W2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srek1ip1Q4V9W2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srek1ip1Q4V9W2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Srek1ip1Q4V9W2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Srek1ip1Q4V9W2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Srek1ip1Q4V9W2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Srek1ip1Q4V9W2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Srek1ip1Q4V9W2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Srek1ip1Q4V9W2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srek1ip1Q4V9W2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srek1ip1Q4V9W2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srek1ip1Q4V9W2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srek1ip1Q4V9W2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srek1ip1Q4V9W2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srek1ip1Q4V9W2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srek1ip1Q4V9W2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srek1ip1Q4V9W2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srek1ip1Q4V9W2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srek1ip1Q4V9W2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Srek1ip1Q4V9W2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srek1ip1Q4V9W2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srek1ip1Q4V9W2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srek1ip1Q4V9W2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srek1ip1Q4V9W2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srek1ip1Q4V9W2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Srek1ip1Q4V9W2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Srek1ip1Q4V9W2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Srek1ip1Q4V9W2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Srek1ip1Q4V9W2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Srek1ip1Q4V9W2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Srek1ip1Q4V9W2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Srek1ip1Q4V9W2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Srek1ip1Q4V9W2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Srek1ip1Q4V9W2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Srek1ip1Q4V9W2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Srek1ip1Q4V9W2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Srek1ip1Q4V9W2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srek1ip1Q4V9W2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srek1ip1Q4V9W2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srek1ip1Q4V9W2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srek1ip1Q4V9W2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srek1ip1Q4V9W2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Srek1ip1Q4V9W2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srek1ip1Q4V9W2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srek1ip1Q4V9W2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srek1ip1Q4V9W2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srek1ip1Q4V9W2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms