Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt35Q497I4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt35Q497I4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt35Q497I4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt35Q497I4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt35Q497I4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt35Q497I4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt35Q497I4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt35Q497I4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt35Q497I4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt35Q497I4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt35Q497I4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt35Q497I4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt35Q497I4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt35Q497I4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt35Q497I4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt35Q497I4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt35Q497I4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt35Q497I4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Krt35Q497I4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Krt35Q497I4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Krt35Q497I4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Krt35Q497I4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Krt35Q497I4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt35Q497I4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt35Q497I4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Krt35Q497I4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt35Q497I4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt35Q497I4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt35Q497I4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt35Q497I4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt35Q497I4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Krt35Q497I4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt35Q497I4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt35Q497I4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt35Q497I4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt35Q497I4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt35Q497I4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Krt35Q497I4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt35Q497I4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt35Q497I4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt35Q497I4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Krt35Q497I4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt35Q497I4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt35Q497I4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt35Q497I4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt35Q497I4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt35Q497I4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt35Q497I4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Krt35Q497I4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt35Q497I4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt35Q497I4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.3■■□□□ 1
Krt35Q497I4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt35Q497I4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt35Q497I4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt35Q497I4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Krt35Q497I4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Krt35Q497I4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt35Q497I4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt35Q497I4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt35Q497I4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt35Q497I4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt35Q497I4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Krt35Q497I4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt35Q497I4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt35Q497I4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Krt35Q497I4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Krt35Q497I4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt35Q497I4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt35Q497I4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt35Q497I4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Krt35Q497I4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt35Q497I4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt35Q497I4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Krt35Q497I4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt35Q497I4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt35Q497I4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt35Q497I4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt35Q497I4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt35Q497I4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt35Q497I4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt35Q497I4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt35Q497I4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt35Q497I4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt35Q497I4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt35Q497I4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt35Q497I4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt35Q497I4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt35Q497I4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt35Q497I4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt35Q497I4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt35Q497I4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt35Q497I4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt35Q497I4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt35Q497I4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt35Q497I4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt35Q497I4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt35Q497I4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt35Q497I4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt35Q497I4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71 ms