Protein–RNA interactions for Protein: Q45HK4

Sh2d1b2, SH2 domain-containing protein 1B2, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d1b2Q45HK4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sh2d1b2Q45HK4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sh2d1b2Q45HK4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sh2d1b2Q45HK4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sh2d1b2Q45HK4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sh2d1b2Q45HK4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sh2d1b2Q45HK4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sh2d1b2Q45HK4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sh2d1b2Q45HK4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sh2d1b2Q45HK4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sh2d1b2Q45HK4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sh2d1b2Q45HK4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sh2d1b2Q45HK4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sh2d1b2Q45HK4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Sh2d1b2Q45HK4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Sh2d1b2Q45HK4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sh2d1b2Q45HK4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sh2d1b2Q45HK4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sh2d1b2Q45HK4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sh2d1b2Q45HK4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sh2d1b2Q45HK4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Sh2d1b2Q45HK4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sh2d1b2Q45HK4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sh2d1b2Q45HK4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sh2d1b2Q45HK4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sh2d1b2Q45HK4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sh2d1b2Q45HK4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sh2d1b2Q45HK4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sh2d1b2Q45HK4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Sh2d1b2Q45HK4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sh2d1b2Q45HK4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sh2d1b2Q45HK4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sh2d1b2Q45HK4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sh2d1b2Q45HK4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sh2d1b2Q45HK4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sh2d1b2Q45HK4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sh2d1b2Q45HK4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Sh2d1b2Q45HK4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sh2d1b2Q45HK4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sh2d1b2Q45HK4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sh2d1b2Q45HK4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sh2d1b2Q45HK4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sh2d1b2Q45HK4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sh2d1b2Q45HK4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sh2d1b2Q45HK4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sh2d1b2Q45HK4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sh2d1b2Q45HK4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sh2d1b2Q45HK4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sh2d1b2Q45HK4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sh2d1b2Q45HK4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sh2d1b2Q45HK4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sh2d1b2Q45HK4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sh2d1b2Q45HK4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Sh2d1b2Q45HK4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sh2d1b2Q45HK4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sh2d1b2Q45HK4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sh2d1b2Q45HK4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sh2d1b2Q45HK4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Sh2d1b2Q45HK4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sh2d1b2Q45HK4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh2d1b2Q45HK4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh2d1b2Q45HK4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh2d1b2Q45HK4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh2d1b2Q45HK4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh2d1b2Q45HK4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh2d1b2Q45HK4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh2d1b2Q45HK4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh2d1b2Q45HK4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh2d1b2Q45HK4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh2d1b2Q45HK4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh2d1b2Q45HK4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sh2d1b2Q45HK4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Sh2d1b2Q45HK4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sh2d1b2Q45HK4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sh2d1b2Q45HK4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sh2d1b2Q45HK4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sh2d1b2Q45HK4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sh2d1b2Q45HK4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Sh2d1b2Q45HK4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sh2d1b2Q45HK4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sh2d1b2Q45HK4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Sh2d1b2Q45HK4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sh2d1b2Q45HK4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sh2d1b2Q45HK4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sh2d1b2Q45HK4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sh2d1b2Q45HK4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sh2d1b2Q45HK4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sh2d1b2Q45HK4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sh2d1b2Q45HK4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sh2d1b2Q45HK4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sh2d1b2Q45HK4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sh2d1b2Q45HK4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sh2d1b2Q45HK4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sh2d1b2Q45HK4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sh2d1b2Q45HK4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sh2d1b2Q45HK4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sh2d1b2Q45HK4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Sh2d1b2Q45HK4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sh2d1b2Q45HK4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sh2d1b2Q45HK4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms